Instituto de Biodiversidad Tropical IBIOTROP
Sobre el instituto
El Instituto de Biodiversidad Tropical IBIOTROP-USFQ es un instituto de investigación multidisciplinario que fomenta la investigación, conservación y otras acciones relacionadas con la biodiversidad y el patrimonio natural y las relaciones positivas ambiente-sociedad en el marco de estrategias de Una Sola Salud (One Health) en el Ecuador y a nivel global.
Nuestros miembros pertenecen a diferentes áreas de conocimiento y a prácticas muy variadas, desde las ciencias naturales a las ciencias sociales y las humanidades, siendo IBIOTROP un lugar de colaboración entre investigadores, estudiantes, profesores y diferentes actores de la sociedad civil, organizaciones gubernamentales y no gubernamentales.
Misión y visión
Misión
Aportar al descubrimiento, conocimiento y conservación de la biodiversidad y el patrimonio natural, creando impactos positivos para el futuro de la humanidad.
Visión
El Instituto de Biodiversidad Tropical IBIOTROP es líder en temas de biodiversidad y patrimonio natural, utilizando su experiencia para avanzar el conocimiento y traducirlo a productos de investigación, desarrollo, gestión, conservación e interpretación de alta relevancia científica y social, aportando a la conservación de la biodiversidad tropical, a la capacitación de investigadores y estudiantes, a la vinculación con la sociedad, a la resolución de problemas del mundo real, al impacto en las políticas y percepciones públicas, y al desarrollo de acciones colaborativas interdisciplinares en los diferentes ámbitos de la conservación, la salud pública y el desarrollo socioambiental.
Áreas de investigación y de interés
- Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales (COCIBA)
Carreras y programas relacionados
Programas académicos vinculados al instituto
Biología
Investigadores que viven la ciencia cada día
Ingeniería en Biotecnología
Aprende con líderes que investigan e innovan
Medicina Veterinaria
Veterinarios en acción
Gestión Ambiental en Galápagos
Protege Galápagos con expertos
Maestría en Ecología Tropical y Conservación
Profesores que investigan, publican y acompañan
Maestría en Microbiología
Profesores que investigan y transforman el conocimiento
Conoce más del instituto
Componentes
El museo de zoología es un repositorio donde preservamos conocimiento sobre la fauna del Ecuador en la forma de miles de especímenes de animales que utilizamos para la investigación, la docencia y la divulgación científica.
Hospital de Fauna Silvestre TUERI
El Hospital de Fauna Silvestre TUERI-USFQ, es el primero de su tipo en Ecuador. Brindamos atención especializada, sin costo y de alta calidad para el tratamiento veterinario de animales silvestres, a nivel de emergencias, hospitalización, rehabilitación y oportunidades de liberación.
Laboratorio de Zoología Terrestre
El Laboratorio de Zoología Terrestre USFQ desarrolla programas de investigación y conservación sobre la evolución, historia natural y conservación de animales terrestres, vertebrados e invertebrados.

Laboratorio de Salud Animal
El Laboratorio de Salud Animal USFQ es una instalación especializada donde llevamos a cabo investigaciones, análisis y pruebas relacionadas con la salud y el bienestar de los animales, nuestro laboratorio se especializa en la detección, diagnóstico y prevención de enfermedades que afectan a los animales, tanto domésticos como salvajes.
El biobanco es un repositorio para muestras de origen humano, animal y vegetal con la capacidad de preservar tejidos, células, semillas, esporas, etc. Estas muestras se preservan para su utilización en investigación.
Servicios
El instituto de biodiversidad tropical presta varios servicios, conócelos.
- Identificación de especies de fauna y flora.
- Consultoría ambiental.
- Consultoría veterinaria.
- Medicina de fauna silvestre y exótica.
- Rehabilitación y reubicación de fauna silvestre.
- Preservación de especímenes de flora y fauna.
- Análisis histológico, parasitológico y hematológico.
- Guía y desarrollo de exhibiciones educativas.
- Asesoría forense.
- Capacitaciones institucionales.
- Preservación de muestras en ultracongeladores a -80° C y en nitrógeno líquido.
Investigación
En proceso:
- Diversidad e historia natural de arañas en Ecuador
- Invertebrados terrestres de las Galápagos: Diversidad, historia natural, biología de las invasiones y ecología urbana-rural-natural
- Diversidad de los Onychophora del Ecuador
- Diversidad e historial natural de arañas Mygalomorphae del Ecuador
- Taxonomía, biogeografía y conservación de anfibios & reptiles
- Historia natural de anfibios y reptiles de la Amazonía Ecuatoriana
- Estrés fisiológico y molecular en anfibios de los altos Andes tropical
- Diversidad, ecología y conservación de las Ranas de Cristal (Amphibia: Centrolenidae) de América del Sur
- Taxonomía y Conservación de ranas terrestres en los páramos, estribaciones y tierras bajas del Ecuador
- Gecos y serpientes de las islas pobladas de Galápagos
- Diversidad, historia natural, biogeografía y conservación de las aves del Ecuador
- Estrés en aves en matrices urbano-rurales en los Andes tropicales y medición de impactos antropogénicos en aves en las islas Galápagos usando un enfoque molecular
- Aves terrestres de las islas pobladas de Galápagos: Historia natural, distribución y situación poblacional
- Impact of habitat changes on the biological diversity of the northern tropical Andes
- Estudio genético de pastos en ambientes naturales
- Dinámica de polinización nocturna en dos especies congéneres de Verbenaceae: Lantana camara (supirrosa) y Lantana peduncularis (Lantana de Galápagos) en la isla San Cristóbal y Santa Cruz, Galápagos, Ecuador.
- Evaluación de la diversidad genética del género endémico Darwiniothamnus Harling (Asteraceae) en Galápagos: implicaciones evolutivas y su utilidad para definir estrategias de conservación
- Estructura y composición de las comunidades Psidium guajava y Psidium galpageium (Myrtaceae) en la isla San Cristóbal, Galápagos.
- Quantifying impacts caused by alien species on native biodiversity and human livelihood in the Galápagos Islands
- Estudio de la biodiversidad en áreas urbanas y rurales
- Linking comparative tools and mechanistic niche models to understand the consequences of size variation on species' vulnerability to global change
- Patrones de actividad de medianos y grandes mamíferos en las estribaciones orientales de los Andes centrales de Ecuador
- Development and use of genomic tools for the conservation of Andean bears
- Un primer paso para diferenciar entre los ataques al ganado causados por perros domésticos y carnívoros salvajes en Ecuador
- Impacto de perros domésticos (Canis familiaris) en comunidades del Parque Nacional Yasuní
Concluidos:
- Aves, reptiles y anfibios del Bosque Protector Puyango, El Oro, Ecuador (financiado por la Prefectura de El Oro)
- INEDITA: Respuestas a la crisis de biodiversidad: La descripción de especies como herramienta de conservación (financiado por Senescyt)
- Biodiversidad, cultura y gastronomía de los pueblos afros de Esmeraldas y el Valle del Chota (financiado por Fundación Activos Culturales Afro ACUA)
- Evaluación biológica rapida del corredor norte de la Reserva de Mashpi (financiado por Fundación Futuro)
- Political Ecology and Violence in the Galapagos Islands (financiado por el Galapagos Science Center, GSC-UNC-USFQ)
- Estructura de la comunidad de arañas tejedoras (Arachnida:Araneidae) a lo largo de un gradiente altitudinal en los Andes nor-orientales ecuatorianos.
- Impacto de la destrucción del hábitat y del cambio climático sobre la diversidad de la Cordillera Oriental: Estado actual, modelamiento de cambios e implicaciónes para la conservación in-situ (financiado por Russell E. Train Fellowship for Postgraduate Studies, Education for Nature, World Wildlife Fund)
- Identificación de enfermedades infecciosas en animales silvestres y domésticos del Ecuador
Sánchez-Carvajal MJ, Reyes-Ortega GC, Cisneros-Heredia DF, Ortega-Andrade HM (2021) Rediscovery of Laura’s glassfrog Nymphargus laurae (Anura: Centrolenidae) with new data on its morphology, colouration, phylogenetic position and conservation in Ecuador. PeerJ, 9, e12644 https://doi.org/10.7717/peerj.12644
Brito-Zapata D, Reyes-Puig C (2021) A new species of terrestrial-breeding frog Pristimantis (Anura: Strabomantidae) from the Cordillera del Cóndor, Zamora Chinchipe, Ecuador. Neotropical Biodiversity, 7(1), 213-222. https://doi.org/10.1080/23766808.2021.1940048
Diaz EA, Donoso G, Saenz C, Aponte PM (2021) Spermatogenesis in a vulnerable South American cervid, dwarf red brocket (Mazama rufina). Anatomia, Histologia, Embryologia. https://doi.org/10.1111/ahe.12766
Brito-Zapata D, Reyes-Puig CR, Cisneros-Heredia DF, Zumel D, Ron SR (2021) Description of a new minute frog of the genus Pristimantis (Anura: Strabomantidae) from Cordillera del Condor, Ecuador. Zootaxa, 5072(4), 351-372. https://doi.org/10.11646/zootaxa.5072.4.3
Medrano-Vizcaíno P, Brito-Zapata D (2021) Filling biogeographical gaps through wildlife roadkills: New distribution records for six snake species from Ecuador (Anilius scytale, Drymarchon corais, Erythrolamprus breviceps, Micrurus lemniscatus, Oxyrhopus vanidicus, Trilepida anthracina), Neotropical Biodiversity, 7(1), 554-559. https://doi.org/10.1080/23766808.2021.2010469
Jordán JP, Domínguez-Trujillo M, Cisneros-Heredia DF (2021) Phylogenetic placement of the spider genus Taczanowskia (Araneae: Araneidae) and description of a new species from Ecuador. Invertebrate Systematics, 35(7), 742-753. https://doi.org/10.1071/IS20084
Tadashima-Rivera AG, Cisneros-Heredia DF, Ramos-Rojas SA, Ramón-Cabrera GM (2021) Observations on Camposella insignata (Diptera: Acroceridae) from the Tropical Andes of Ecuador. Neotropical Biodiversity, 7(1), 523-529. https://doi.org/10.1080/23766808.2021.2000293
Díaz EA, Sáenz C, Segnini G, Villagómez A, Díaz RF, Zug R (2021) Dystocia and cesarean section in a free-ranging ocelot (Leopardus pardalis) after traumatic spinal cord injury resulting from dog (Canis familiaris) attack. Open Veterinary Journal, 11(3), 422-430. http://dx.doi.org/10.5455/OVJ.2021.v11.i3.14
Brito-Zapata D (2021) First report of partial leucism in the poison frog Epipedobates anthonyi (Anura: Dendrobatidae) in El Oro, Ecuador. Neotropical Biodiversity, 7(1), 1-4. https://doi.org/10.1080/23766808.2020.1870256
Yánez-Muñoz MH, Reyes-Puig JP, Batallas-Revelo D, Broaddus C, Urgilés-Merchán M, Cisneros-Heredia DF, Guayasamin JM (2021) A new Andean treefrog (Amphibia: Hyloscirtus bogotensis group) from Ecuador: an example of community involvement for conservation. PeerJ, 9, e11914. https://doi.org/10.7717/peerj.11914
Díaz EA, Sáenz C, Jiménez ES, Egas DA, Swing K (2021) Is release of rehabilitated wildlife with embedded lead ammunition advisable? Plumbism in a Jaguar Panthera onca (Mammalia: Carnivora: Felidae), survivor of gunshot wounds. Journal of Threatened Taxa, 13(12), 19808-19812. https://doi.org/10.11609/jott.5777.13.12.19808-19812
Muriel R, Pérez N, Benitez DD, Riofrío D, Ramón G, Peñaherrera E, Cisneros-Heredia DF (2021) BeetleID: An Android Solution to Detect Ladybird Beetles. 2021 IEEE Fifth Ecuador Technical Chapters Meeting (ETCM) (pp. 1-6). https://doi.org/10.1109/ETCM53643.2021.9590826
Venegas P, Calderon F, Riofrío D, Benítez D, Ramón G, Cisneros-Heredia DF, Coimbra M, Rojo-Álvarez JL, Pérez N (2021) Automatic ladybird beetle detection using deep-learning models. PloS ONE, 16(6), e0253027. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0253027
Arauz PG, Chiriboga P, García MG, Kao I, Díaz EA (2021). New technologies applied to canine limb prostheses: A review. Veterinary World, 14(10), 2793-2802. https://doi.org/10.14202%2Fvetworld.2021.2793-2802
Sánchez-Nivicela M, Avendaño JE, Sánchez-Nivicela JC, Torres A, Fuchs J, Bird B, Bonaccorso E (2021) A taxonomic assessment of Chlorospingus flavopectus phaeocephalus and Chlorospingus semifuscus (Passeriformes: Passerellidae), including the description of a new subspecies. Zootaxa, 5057(2), 151-180. https://doi.org/10.11646/zootaxa.5057.2.1
Diaz E, Hidalgo A, Villamarin C, Donoso G, Barragan V (2021) Vector-borne zoonotic blood parasites in wildlife from Ecuador: A report and systematic review. Veterinary World, 14(7), 1935–1945. https://doi.org/10.14202/vetworld.2021.1935-1945
Armijos-Ojeda D, Székely D, Székely P, Cogălniceanu D, Cisneros-Heredia DF, Ordóñez-Delgado L, Escudero A, Espinosa CI (2021) Amphibians of the equatorial seasonally dry forests of Ecuador and Peru. ZooKeys, 1063, 23–48. https://doi.org/10.3897/zookeys.1063.69580
Deepak V, Passos P, Nagy ZT, Zaher H, Šmíd J, Nguyen TQ, Carranza S, Cisneros-Heredia DF, David P, Tamar K, Gower DJ (2021) Contributions to ophiology in Zootaxa 2001–2020: patterns and trends. Zootaxa, 4979(1), 17-22. https://doi.org/10.11646/zootaxa.4979.1.4
Villafañe-Trujillo ÁJ, Kolowski JM, Cove MV, Medici EP, Harmsen BJ, Foster RJ, …, López-González CA (2021) Activity patterns of tayra (Eira barbara) across their distribution. Journal of Mammalogy, 102(3), 772–788. https://doi.org/10.1093/jmammal/gyaa159
Lizana V, Martínez-Carrasco C, Mosquera D, Vinueza HG, Romo D, Swing K, Cardells J, Díaz EA (2021). Scavenging behavior of the Short-eared Dog (Atelocynus microtis) in Ecuadorian lowland rainforest. Studies on Neotropical Fauna and Environment. https://doi.org/10.1080/01650521.2021.1897379
Peñaherrera-R. P, & Pinos-Sánchez A (2021) Primer registro de eritrismo parcial en una especie de rana venenosa de la familia Dendrobatidae: Epipedobates darwinwallacei Cisneros-Heredia y Yánez-Muñoz, 2010. ACI Avances en Ciencias e Ingenierías, 13(2), 1–7. https://doi.org/10.18272/aci.v13i2.2287
Vega M, Benítez DS, Pérez N, Riofrío D, Ramón G, Cisneros-Heredia DF (2021) Coccinellidae Beetle Specimen Detection Using Convolutional Neural Networks. 2021 IEEE Colombian Conference on Applications of Computational Intelligence (ColCACI) (pp. 1-5). https://doi.org/10.1109/ColCACI52978.2021.9469588
de la Torre A, Coyohua Fuentes A, Rangel Negrín A, Velarde-Garcéz DA, Canales Espinosa D, Cervantes Acosta P, Dias PAD. (2021) Maternal care according to offspring sex and maternal physical condition in mantled howler monkeys (Alouatta palliata). Primates, 62, 379–388. https://doi.org/10.1007/s10329-020-00883-6
Sánchez-Nivicela JC, Urgiles VL, Cedeño-Palacios J, Abad-Peñafiel H, Guayasamin JM (2021) Una fantástica nueva especie del grupo Pristimantis orcesi de los Andes sur de Ecuador. Neotropical Biodiversity, 6(1), 224-237. https://doi.org/10.1080/23766808.2020.1869449
Ortega-Andrade HM, Rodes Blanco M, Cisneros-Heredia DF, Guerra Arévalo N, López de Vargas-Machuca KG, Sánchez-Nivicela JC, …, Yánez Muñoz MH (2021) Red List assessment of amphibian species of Ecuador: A multidimensional approach for their conservation. PloS one, 16(5), e0251027. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0251027
Ver más publicaciones en:
https://scholar.google.com/citations?hl=es&user=L05t6WoAAAAJ
Nombre Entidad: The Natural History Museum, London
País: Reino Unido
Tipo de colaboración: Convenio
Nombre Entidad: IUCN-SSC International Union for the Conservation of Nature, Species Survival Commission
País: Estados Unidos
Tipo de colaboración: Alianza
Nombre Entidad: Ministerio de Ambiente, Agua y Transición Ecológica del Ecuador
País: Ecuador
Tipo de colaboración: Convenio
Nombre Entidad: Policía Nacional del Ecuador, Unidad de Protección del Medio Ambiente UPMA
País: Ecuador
Tipo de colaboración: Convenio
Nombre Entidad: Jardín Alado
País: Ecuador
Tipo de colaboración: Convenio
Nombre Entidad: Instituto Nacional de Biodiversidad INABIO
País: Ecuador
Tipo de colaboración: Convenio
Nombre Entidad: Fundación EcoMinga
País: Ecuador
Tipo de colaboración: Convenio
https://noticias.usfq.edu.ec/2021/06/miles-de-animales-silvestres-han-sido.html
https://noticias.usfq.edu.ec/2021/08/diego-cisneros-heredia-y-juan-manuel.html
https://noticias.usfq.edu.ec/2021/04/una-puma-fue-liberada-en-su-nuevo.html
https://noticias.usfq.edu.ec/2021/06/diego-cisneros-heredia-docente-de-la.html
https://noticias.usfq.edu.ec/2020/06/condor-andino-hembra-es-internada-en.html
https://noticias.usfq.edu.ec/2019/06/nuevas-especies-demuestran-la.html
Intereses de investigación
Taxonomía, sistemática, biogeografía e historia natural
Una Sola Salud (One Health)
Ecología urbana y rural
Ecología tropical
Medicina de la conservación y veterinaria de fauna silvestre
Salud de fauna silvestre
Estudios sobre relaciones ambiente-sociedad
Conservación de vida silvestre y patrimonio natural
Etnobiología
Desarrollo sostenible, ecología humana y ecología política
Manejo de recursos naturales y servicios ambientales




