Laboratorio de Biotecnología y Genómica
Sobre el laboratorio
El Laboratorio de Biotecnología y Genómica desarrolla diferentes proyectos de investigación, con el fin de entender mejor la biodiversidad existente en el país, conservar las especies y ecosistemas, y mejorar las prácticas agrícolas existentes.
El Laboratorio de Biotecnología Vegetal realiza diversos proyectos de investigación utilizando principalmente herramientas de biología molecular y cultivo in vitro de plantas. El enfoque principal del Laboratorio son las plantas, por ello investigadores y estudiantes interesados tienen la oportunidad de desarrollar proyectos e iniciativas en este campo. Además, el Laboratorio colabora con investigadores de otras áreas para llevar a cabo estudios interdisciplinarios, principalmente relacionados con diversidad genética de animales.
Misión y visión
Misión
Desarrollar proyectos de investigación de impacto con especies de importancia para la agricultura, el ambiente, la conservación y la economía del país. El laboratorio desarrolla investigación en plantas, animales y microorganismos, mediante el uso de herramientas de cultivo in vitro de plantas, biología molecular, genómica y bioinformática, promoviendo además proyectos interdisciplinarios y colaboraciones nacionales e internacionales.
Visión
Nuestros objetivos principales son: Entender mejor la biodiversidad existente en el país, conservar las especies y ecosistemas, contribuir al mejoramiento de las prácticas agrícolas existentes.
Carreras y programas relacionados
Programas académicos vinculados al laboratorio
Biología
Investigadores que viven la ciencia cada día
Ingeniería en Biotecnología
Aprende con líderes que investigan e innovan
Doctorado en Microbiología
Trabaja con investigadores que generan impacto
Maestría en Microbiología
Profesores que investigan y transforman el conocimiento
Conoce más del laboratorio
Investigación
Diversidad Genética Vegetal
Nos enfocamos en el estudio de la biodiversidad vegetal existente en el país para conservación de especies y ecosistemas y para aplicaciones en mejoramiento de prácticas agrícolas.
Algunas de las investigaciones que llevamos a cabo son:
- Determinación preliminar de la diversidad genética del guayabillo (Psidium galapageium) y la guayaba (Psidium guajava) en las Islas Isabela, Santa Cruz y San Cristóbal, Galápagos, comparación de la diversidad de la guayaba con muestras recolectadas de varias provincias del Ecuador continental
- Estudio de diversidad genética de quinoa (Chenopodium quinoa) de 8 provincias de la Sierra ecuatoriana
- Estandarización de primers de SSR específicos para Ilex guayusa
- Estandarización de primers específicos para la amplificación de regiones SSR en mortiño (Vaccinium floribundum Kunth)
- Estudio de diversidad genética de mortiño (Vaccinium floribundum Kunth) en la Sierra ecuatoriana
Expresión Génica
Investigamos la expresión de genes en ciertas especies vegetales para comprender mecanismos de resistencia a diferentes condiciones ambientales. Por ejemplo llevamos a cabo el siguiente proyecto:
Cuantificación relativa de la expresión de genes candidatos de tolerancia a salinidad en tomate de árbol (Solanum betaceum) mediante la técnica RT-qPCR
Cultivo in vitro
Nos interesa investigar la propagación y regeneración in vitro de diferentes especies vegetales para aplicaciones en mejoramiento de prácticas de agricultura.
Algunas de los proyectos que se están realizando en el laboratorio son:
- Regeneración in vitro de naranjilla (Solanum quitoense) a partir de explantes de hipocotilos, peciolos y yemas apicales
- Micropropagación in vitro de Ilex guayusa a través de segmentos nodales
- Micropropagación in vitro de caimito (Pouteria caimito)
- Propagación in vitro de mortiño (Vaccinium floribundum Kunth)
Autoincompatibilidad
Estamos investigando la autocompatibilidad en capulí en dos proyectos:
- Estudio preliminar fenotípico de la autoincompatibilidad gametofítica capulí (Prunus serotina subsp. capuli)
- Caracterización molecular del gen de la S-RNasa en capulí (Prunus serotina subsp. capuli)
Diversidad Genética Animal
Colaboramos con diferentes investigadores dentro y fuera de la USFQ para estudiar la genética de diferentes grupos animales. Actualmente estamos involucrados en los siguientes proyectos:
- Diversidad genética del Oso de Anteojos (Tremarctos ornatus) en el Distrito Metropolitano de Quito mediante el análisis de ADN mitocondrial
- Diversidad genética del atún de aleta amarilla (Thunnus albacares) entre Ecuador y México usando loci microsatélite
- Diversidad genética y estructura poblacional de Manta birostris en la Isla de la Plata, Ecuador
- Diversidad genética de ballenas
Publicaciones
Revistas peer reviewed
Jennifer Fiallos-Jurado, Jacob Pollier, Tessa Moses, Philipp Arendt, Noelia Barriga-Medina, Eduardo Morillo, Venancio Arahana, Maria de Lourdes Torres, Alain Goossens. 2016. Saponin determination, expression analysis and functional characterization of saponin biosynthetic genes in Chenopodium quinoa leaves. Plant Science. 250: 188 – 197.
María Mercedes Cobo, Bernardo Gutiérrez, Andrés F. Torres, María de Lourdes Torres. 2016. Preliminary analysis of the genetic diversity and population structure of mortiño (Vaccinium floribundum Kunth). Biochemical Systematics and Ecology. 64: 14 – 21.
Juan J. Guadalupe, Bernardo Gutiérrez, Dámaris P. Intriago-Baldeón, Venancio Arahana, José Tobar, Andrés F. Torres, María de Lourdes Torres. 2015. Genetic diversity and distribution patterns of Ecuadorian capuli (Prunus serotina). Biochemical Systematics and Ecology. 60: 67 – 73.
Estefanía Espinosa Mata, Stella de la Torre, Venancio S. Arahana B., María de Lourdes Torres P. 2015. Evaluación del nivel de estrés en leoncillos (Cebuella pygmaea) mediante la medición de cortisol en heces. Avances en Ciencias e Ingenierías. 7 (2): B24 – B29. enlace
Joely Vega, Venancio S. Arahana B., María de Lourdes Torres. 2015. Estandarización de un protocolo de regeneración de cebolla chalote (Allium cepa var. aggregatum) a partir de meristemas apicales. Avances en Ciencias e Ingenierías. 7 (1): B24 – B31. enlace
Milton Gordillo, José Tobar, Venancio S. Arahana B., María de Lourdes Torres. 2015. Identificación de alelos S asociados con autoincompatibilidad en individuos de capulí (Prunus serótina subsp. capulí) mediante la amplificación del Intrón I del gen de la S-RNasa. Avances en Ciencias e Ingenierías. 7 (1): B17 – B23. enlace
Viviana Jaramillo, Venancio Arahana y María de Lourdes Torres. 2014. Determinación del nivel de tolerancia a salinidad en condiciones in vitro de plantas de tomate de árbol (Solanum betaceum) provenientes de distintas localidades de la Sierra ecuatoriana. Avances en Ciencias e Ingenierías. 6 (1): B44 – B50. enlace
María de Lourdes Torres P., Lorena Mejía, Venancio S. Arahana B. 2013. Estandarización de un protocolo para detección de OGMs: evaluación de la presencia de OGMs en granos de soya colectados en diferentes centros de acopio de Ecuador. Avances en Ciencias e Ingenierías. 5 (1): B40 – B48. enlace
Venancio S. Arahana B., Nicolás Bastidas, María de Lourdes Torres P., Pedro González. 2013. Genetic diversity of an entomopathogenic fungi collection from Ecuador using a modified AFLP approach. Avances en Ciencias e Ingenierías. 5 (1): B49 – B57. enlace
Cristina Salgado, Venancio Arahana, José Tobar, Bernardo Gutiérrez, María de Lourdes Torres. 2013. Employing molecular markers to identify Monilinia fructicola in Ecuadorian peach orchards. Australasian Plant Disease Notes. 8 (1): 149 – 152. enlace
Actividades
Amor Naturae 2017
Taller práctico de Biotecnología Vegetal – Germinación de semillas in vitro
Grupo de trabajo
- Alejandro Alvear
- Gabriela Bruque
- Juan Salazar
- Liseth Salazar
- Milton Gordillo
- Nina Espinosa de los Monteros
- Alison Reinoso
- Analía Espín
- Andrea Argudo
- Andrea Soria
- Carlos Vintimilla
- Carolina Cazco
- Carolina Jaramillo
- Daniela Rojas
- Darío Cueva
- Diego Urquía
- Izán Chalen
- Juan Esteban Zurita
- Lisa Correa
- Martín Terán
- Michelle Rodríguez
- Miguel Orellana
- Nathalia Valencia
- Pamela Vega
- Ricardo Campoverde
- Sebastián Vinueza
- Sofía Donoso
- Verónica Baquero