Instituto de Microbiología

Investigadores Asociados USFQ

Investigadores asociados Externos

Scientific publications

List of publications: https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=8aCv1dwAAAAJ

→ 2025

• Estefania Peña-Zuñiga, Noelia Barriga-Medina, Dario Ramirez-Villacis, Sol Llerena-Llerena, Jos M. Raaijmakers, Corné Pieterse, and Antonio Leon-Reyes. First report of Rhizoctonia solani AG-3 causing black scurf on Solanum tuberosum cv. Superchola in Cotopaxi, Ecuador. APS Online Publications. 2025. https://doi.org/10.1094/PDIS-12-24-2575-PDN
• Manuel E. Baldeon, Paul Cardenas, Valentina Arevalo, Belen Prado-Vivar, Mario Uchimiya, Lizbeth Peña, Andrea Denisse Benitez, Andrés Suárez-Jaramillo, Arthur S. Edison, Alonso Herrera, Linda Arturo and Marco Fornasini. Human Milk Microbiota Across Lactation Stages and Free Glutamate Concentrations in Healthy Ecuadorian Women. MDPI-Nutrients. 2025. https://doi.org/10.3390/nu17050805
• Lázaro López, Diana Calderón, Liseth Salinas, Jay P. Graham, Zachary D. Blount, Gabriel Trueba. A plasmid with the bla CTX-M gene enhances the fitness of Escherichia coli strains under laboratory conditions. MICROBIOLOGY SOCIETY. 2025. https://doi.org/10.1099/mic.0.001525
• Paúl León- Gómez, Vanessa I. Romero. Human papillomavirus, vaginal microbiota and metagenomics: the interplay between development and progression of cervical cancer. Frontiers Frontiers in Microbiology. 2025. https://doi.org/10.3389/fmicb.2024.1515258
• Denyss Guilcazo, Liseth Salinas, Cristina Chávez, Katherine Vásquez, Gabriela I. Méndez, Lance B. Price, Jay P. Graham, Joseph N. S. Eisenberg, Gabriel Trueba. Tracking blaCTX-M transmission through transposable elements in uropathogenic and commensal E. coli. Taylor & Francis Future Microbiology. 2025. https://doi.org/10.1080/17460913.2025.2459526
• Jacob van der Ende , Victoria Nipaz, Andres Carrazco-Montalvo, Gabriel Trueba, Martin P. Grobusch, and Josefina Coloma. Cocirculation of 4 Dengue Virus Serotypes, Putumayo Amazon Basin, 2023–2024. CDC EMERGING INFECTIOUS DISEASES. 2025. 10.3201/eid3101.240888 https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/31/1/24-0888_article

→ 2024

• Paúl León, Paula Franco, Nicole Hinojosa, Kevin Torres, Andrés Moreano, Vanessa I. Romero. TTN Novel Splice Variant in Familial Dilated Cardiomyopathy and Splice Variants Review: A Case Report. Frontiers in Cardiovascular Medicine- Cardiovascular Genetics and Systems Medicine. 2024. https://doi.org/10.3389/fcvm.2024.1387063
• Jaap-Jan Willing, Nina Guarneri, Thomas van Loon, Sri Wahyuni, Ivan E Astudillo-Estévez, Lin Xu, Viola Willemsen, Aska Goverse, Mark G Sterken, Jose L Lozano-Torres, Jaap Bakker, Geert Smant. Transcription factor WOX11 modulates tolerance to cyst nematodes via adventitious lateral root formation. Oxfor Academic Plant Physiology. 2024. https://doi.org/10.1093/plphys/kiae053
• Paulina Andrade, Andrea Sosa-Moreno, Sandra Vivero, Victoria Nipaz, Gwenyth O. Lee, William Cevallos, Joseph N. S. Eisenberg, and Josefina Coloma. The Impact of Zika Emergence in Remote Communities in Northwestern Ecuador. The Jornal of Infectious Diseases-OXFORD ACADEMIC 2024. https://doi.org/10.1093/infdis/jiae384
• Nicolás Renato Jara-Medina, Dario Fernando Cueva, Ariana Cecibel Cedeño-Pinargote, Arleth Gualle, Daniel Aguilera-Pesantes, Miguel Ángel Méndez, Lourdes Orejuela-Escobar, Diego F. Cisneros-Heredia, Rebeca Cortez-Zambrano, Nelson Miranda-Moyano, Eduardo Tejera, Antonio Machado. Eco-alternative treatments for Vibrio parahaemolyticus and V. cholerae biofilms from shrimp industry through Eucalyptus (Eucalyptus globulus) and Guava (Psidium guajava) extracts: A road for an Ecuadorian sustainable economy. PLOS ONE. 2024. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0304126

→ 2023

• Liseth Salinas, Paúl Cárdenas, Jay P. Graham, Gabriel Trueba. IS26 drives the dissemination of blaCTX-M genes in an Ecuadorian community. Microbiology Spectrum ASM Journals. 2023. https://doi.org/10.1128/spectrum.02504-23
• Gabriela Vasco, Mishell Achig, Belén Prado-Vivar, Maritza Páez, Franklin Espinosa, Evelyn Espinoza, Danny Quinancela, Paúl Cárdenas, Gabriel Trueba. Endogenous origin of Pseudomonas aeruginosa infecting hospitalized patients in Ecuador. Science Direct Elsevier. 2023. https://doi.org/10.1016/j.infpip.2023.100331
• Heather K. Amato, Fernanda Loayza, Liseth Salinas, Diana Paredes, Daniela Garcia, Soledad Sarzosa, Carlos Saraiva-Garcia, Timothy J. Johnson, Amy J. Pickering, Lee W. Riley †, Gabriel Trueba, Jay P. Graham. Risk factors for extended-spectrum beta-lactamase (ESBL)-producing E. coli carriage among children in a food animal-producing region of Ecuador: A repeated measures observational study. PLOS MEDICINE. 2023. https://doi.org/10.1371/journal.pmed.1004299
• Heather K. Amato, Fernanda Loayza, Liseth Salinas, Diana Paredes, Daniela García, Soledad Sarzosa, Carlos Saraiva-Garcia, Timothy J. Johnson, Amy J. Pickering, Lee W. Riley, Gabriel Trueba, Jay P. Graham. Leveraging the COVID-19 pandemic as a natural experiment to assess changes in antibiotic use and antibiotic-resistant E. coli carriage in semi-rural Ecuador. Nature/ Scientific reports. 2023. https://doi.org/10.1038/s41598-023-39532-5
• Yaohua You, Iván Astudillo-Estévez, Bert Essenstam, Si-Qin, Juan A.L. van Kan. Leaf resistance to Botrytis cinerea in wild tomato Solanum habrochaites depends on inoculum composition. Frontiers in Plant Science. 2023. https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1156804
• Paúl Cárdenas, Sully Márquez, Gabriel Trueba, Josefina Coloma. Arbovirus researchers unite: expanding genomic surveillance for an urgent global need. The Lancet Global Health. 2023. https://www.thelancet.com/journals/langlo/article/PIIS2214-109X(23)00325-X/fulltext#%20 https://doi.org/10.55876/p230704
• Aracely Zambrano-Romero, Darío X. Ramirez-Villacís, Noelia Barriga-Medina, Reyes Sierra-Álvarez, Gabriel Trueba, Valeria Ochoa-Hererra, Antonio León-Reyes. Comparative Methods for Quantification of Sulfate-Reducing Bacteria in Environmental and Engineered Sludge Samples. MDPI- Biology. 2023. https://doi.org/10.3390/biology12070985
• Sully Márquez, Wenyth O. Lee, Bernardo Gutiérrez, Shannon Bennett, Josefina Coloma, Joseph N.S. Eisenberg and Gabriel Trueba. Phylogenetic Analysis of Transmission Dynamics of Dengue in Large and Small Population Centers, Northern Ecuador. CDC- Centers for Disease Control and Prevention/ Emerging Infectious Diseases. 2023. 10.3201/eid2905.221226
• Sandra Pamela Cangui-Pachi, Anahí Lizbeth Ñacato-Toapanta, Leonardo Joshué Enríquez-Martínez, Gabriela Alexandra Salinas-Delgado, Jorge Reyes, Daniel Garzón-Chávez, Antonio Machado. Battle royale: Immune response on biofilms – host-pathogen interactions. Current Research in Immunology/ Science Direct. 2023. https://doi.org/10.1016/j.crimmu.2023.100057
• Paulina Fernández- Soto, Diana Celi, Eduardo Tejera, José Miguel Álvarez- Suárez, Antonio Machado, Pamela Cangui, Fausto Cabezas. Cinnamomum sp. and Pelargonium odoratissimum as the Main Contributors to the Antibacterial Activity of the Medicinal Drink Horchata: A Study Based on the Antibacterial and Chemical Analysis of 21 Plants. Molecules (Journal Impact Factor 4.927 en 2021, Q1 en Pharmaceutical Science). 2023. https://doi.org/10.3390/molecules28020693
• Xavier Valenzuela, Hayden Hedman, Alma Villagomez, Paul Cardenas, Joseph N.S. Eisenberg, Karen Levy, Lixin Zhang, Gabriel Trueba. Distribution of blaCTX-M-gene variants in E. coli from different origins in Ecuador. Science Direct/ Medicine in Microecology. 2023. https://doi.org/10.1016/j.medmic.2023.100092
• Moncayo M, Terán E, Reyes J, Yerovi G, Robalino M, Aguilar AC, Garzón-Chávez D. Identification of the Genotypes Circulating in the Ecuadorian Population Infected with the Hepatitis C Virus (HCV). Dovepress. 2023. https://doi.org/10.2147/RMHP.S412599
• Valentina Arévalo-Granda, Aileen Hickey-Darquea, Belén Prado-Vivar, Sonia Zapata, Jessica Duchicela, Pieter Van't Hof. Exploring the mycobiome and arbuscular mycorrhizal fungi associated with the rizosphere of the genus Inga in the pristine Ecuadorian Amazon. Frontiers in Fungal Biology. 2023. https://doi.org/10.3389/ffunb.2023.1086194
• Darío X. Ramírez- Villacís, Andrea Pinos-León, Pamela Vega- Polo, Isai Salas- González, Cobrin D. Jones, María de Lourdes Torres. Untangling the Effects of Plant Genotype and Soil Conditions on the Assembly of Bacterial and Fungal Communities in the Rhizosphere of the Wild Andean Blueberry (Vaccinium floribundum Kunth). MDPI. 2023. https://doi.org/10.3390/microorganisms11020399
• Paulina Fernández- Soto, Diana Celi, Eduardo Tejera, José Miguel Álvarez- Suárez, Antonio Machado, Pamela Cangui, Fausto Cabezas. Cinnamomum sp. and Pelargonium odoratissimum as the Main Contributors to the Antibacterial Activity of the Medicinal Drink Horchata: A Study Based on the Antibacterial and Chemical Analysis of 21 Plants. Molecules (Journal Impact Factor 4.927 en 2021, Q1 en Pharmaceutical Science). 2023. https://doi.org/10.3390/molecules28020693
• Stalin Sarango Flores, Viviane Cordovez, Ben O. Oyserman, Nejc Stopnisek, Jos M. Raaijmakers, and Pieter Van't Hof. The Tomato’s Tale: Exploring taxonomy, biogeography, domestication and microbiome for enhanced resilience. APS Publications. 2023. https://doi.org/10.1094/PBIOMES-09-23-0091-MF
• Sarah Rhea, Catherine Gensler, Nigatu Atlaw, Monique Pairis-Garcia, Gregory A Lewbart, Alyssa Valentine, Marilyn Cruz, Paulina Castillo, Alberto Vélez, Gabriel Trueba, Megan E Jacob. Presence of Extended-Spectrum Beta-Lactamase-Producing Escherichia coli in Food-Producing and Companion Animals and Wildlife on Small-Holder Farms of Floreana Island, Galápagos Islands. PubMed NIH- National Library of Medicine. 2023. 10.1089/vbz.2023.0044
• Julian Ruiz-Saenz, Veronica Barragan, Colón Jaime Grijalva-Rosero, Eduardo A. Diaz and Diego Páez-Rosas. Seroconversion in Galapagos Sea Lions (Zalophuswollebaeki) Confirms the Presence of Canine Distemper Virus in Rookeries of San Cristóbal Island. MDPI Animals. 2023. https://doi.org/10.3390/ani13233657
• Kelsey J Jesser, Gabriel Trueba, Konstantinos T. Konstantinidis & Karen Levy. Why are so many enteric pathogen infections asymptomatic? Pathogen and gut microbiome characteristics associated with diarrhea symptoms and carriage of diarrheagenic E. coli in northern Ecuador. Taylor & Francis Online/Gut Microbes. 2023. https://doi.org/10.1080/19490976.2023.2281010
• Worldwide Antimicrobial Resistance National/International Network Group (WARNING) Collaborators. Ten golden rules for optimal antibiotic use in hospital settings: the WARNING call to action. World Journal of Emergency Surgery/ Biomed Central BMC. 2023. https://doi.org/10.1186/s13017-023-00518-3
• D.A. Andrade-Molina, G.A. Morey-León, K.E. Muñoz-Mawyin, F.F. Cruz-Fatuly, J.C. Fernández-Cadena, P. Cárdenas. First sequenced cases of Omicron BA.2 sublineage in Ecuador. Science Direct/ Virus Research. 2023. https://doi.org/10.1016/j.virusres.2023.199169
• Paúl A. Cárdenas, Michael J. Cox, Saffron A. Willis-Owen, Miriam F. Moffatt, William O. Cookson, Phillip J. Cooper. Delayed acquisition of airway commensals in antibiotic naïve children and its relationship with wheezing in rural Ecuador. Frontiers. 2023. https://doi.org/10.3389/falgy.2023.1214951
• Antonio Machado, Lizbeth Zamora-Mendoza, Frank Alexis and José Miguel Álvarez Suárez. Use of Plant Extracts, Bee-Derived Products, and Probiotic-Related Applications to Fight Multidrug-Resistant Pathogens in the Post-Antibiotic Era. Future Pharmacology MDPI. 2023. https://www.mdpi.com/2673-9879/3/3/34
• Andrew P. Rothstein, Kelsey J. Jesser, Dorian J. Feistel, Konstantinos T. Konstantinidis, Gabriel Trueba, Karen Levy. Population genomics of diarrheagenic Escherichia coli uncovers high connectivity between urban and rural communities in Ecuador. ScienceDirect Infection, Genetics and Evolution. 2023. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2023.105476
• Erica R Fuhrmeister PhD, Abigail P Harvey MEng, Maya Nadimpalli PhD, Karin Gallandat PhD, Prof Argaw Ambelu PhD, Benjamin Arnold PhD, Joe Brown PhD, Oliver Cumming MSc, Ashlee Earl PhD, Prof Gagandeep Kang PhD, Prof Samuel Kariuki PhD, Prof Karen Levy PhD, Chris E Pinto Jimenez PhD, Jenna Swarthout PhD, Prof Gabriel Trueba PhD, Pablo Tsukayama PhD, Colin J Worby PhD, Amy J Pickering PhD. Evaluating the relationship between community water and sanitation access and the global burden of antibiotic resistance: an ecological study. ScienceDirect The Lancet Microbe. 2023. https://doi.org/10.1016/S2666-5247(23)00137-4
• Manuel Calvopiña, Daniel Romero-Álvarez, Eduardo Vásconez, Gabriela Valverde-Muñoz, Gabriel Trueba, Miguel Ángel García-Bereguiain, Solon Alberto Orlando. Leptospirosis in Ecuador: Current Status and Future Prospects. MDPI. 2023. https://doi.org/10.3390/tropicalmed8040202 https://www.mdpi.com/2414-6366/8/4/202
• Universidad de las Américas, Quito, Ecuador (D. Romero-Alvarez); University of Kansas, Lawrence, Kansas, USA (D. Romero-Alvarez, A.T. Peterson); Universidad San Francisco de Quito, Quito, Ecuador (D. Garzon-Chavez); Colorado State University, Fort Collins, Colorado, USA (M. Jackson, C. Avanzi). Mycobacterium leprae in Armadillo Tissues from Museum Collections, United States. Centers for Disease Control and Prevention CDC/ Emerging Infectious Diseases. 2023. https://doi.org/10.3201/eid2903.221636

→ 2022

• Olalla Barreiro-Costa, Cristina Quiroga Lozano, Erika Muñoz, Patricio Rojas-Silva, Andrea Medeiros, Marcelo A. Comini, Jorge Heredia-Moya. Evaluation of the anti-Leishmania mexicana and -Trypanosoma brucei activity, and mode of action of 4,4′-(arylmethylene)bis(3-methyl-1-phenyl-1H-pyrazol-5-ol). Biomedicines 2022, 10(8), 1913; https://doi.org/10.3390/biomedicines10081913
• Carrazco-Montalvo, A.; Herrera-Yela, A.; Alarcón-Vallejo, D.; Gutiérrez-Pallo, D.; Armendáriz-Castillo, I.; Andrade-Molina, D.; Muñoz-Mawyin, K.; Fernández-Cadena, J.C.; Morey-León, G.; USFQ-COVID-19 Consortium; CRN Influenza y OVR—INSPI; Patiño, L. Omicron Sub-Lineages (BA.1.1.529 + BA.*) Current Status in Ecuador. Viruses 2022, 14, 1177. https://doi.org/10.3390/v14061177
• Keiya Uriu, Paúl Cárdenas, Erika Muñoz, Veronica Barragan, Yusuke Kosugi, Kotaro Shirakawa, Akifumi Takaori-Kondo, Ecuador-COVID19 Consortium, The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium, Kei Sato. Characterization of the immune resistance of SARS-CoV-2 Mu variant and the robust immunity induced by Mu infection. The Journal of Infectious Disease 2022, jiac053, https://doi.org/10.1093/infdis/jiac053
• Meng, B., Abdullahi, A., Ferreira, I.A.T.M., Goonawardane, N., Saito, A., Kimura, I., Yamasoba, D., Gerber, P.P., Fatihi, S., Rathore, S., Zepeda, S.K., Papa, G., Kemp, S.A., Ikeda, T., Toyoda, M., Tan, T.S., Kuramochi, J., Mitsunaga, S., Ueno, T., Shirakawa, K., Takaori-Kondo, A., Brevini, T., Mallery, D.L., Charles, O.J., Baker, S., Dougan, G., Hess, C., Kingston, N., Lehner, P.J., Lyons, P.A., Matheson, N.J., Ouwehand, W.H., Saunders, C., Summers, C., Thaventhiran, J.E.D., Toshner, M., Weekes, M.P., Maxwell, P., Shaw, A., Bucke, A., Calder, J., Canna, L., Domingo, J., Elmer, A., Fuller, S., Harris, J., Hewitt, S., Kennet, J., Jose, S., Kourampa, J., Meadows, A., O’Brien, C., Price, J., Publico, C., Rastall, R., Ribeiro, C., Rowlands, J., Ruffolo, V., Tordesillas, H., Bullman, B., Dunmore, B.J., Gräf, S., Hodgson, J., Huang, C., Hunter, K., Jones, E., Legchenko, E., Matara, C., Martin, J., Mescia, F., O’Donnell, C., Pointon, L., Shih, J., Sutcliffe, R., Tilly, T., Treacy, C., Tong, Z., Wood, J., Wylot, M., Betancourt, A., Bower, G., Cossetti, C., De Sa, A., Epping, M., Fawke, S., Gleadall, N., Grenfell, R., Hinch, A., Jackson, S., Jarvis, I., Krishna, B., Nice, F., Omarjee, O., Perera, M., Potts, M., Richoz, N., Romashova, V., Stefanucci, L., Strezlecki, M., Turner, L., De Bie, E.M.D.D., Bunclark, K., Josipovic, M., Mackay, M., Butcher, H., Caputo, D., Chandler, M., Chinnery, P., Clapham-Riley, D., Dewhurst, E., Fernandez, C., Furlong, A., Graves, B., Gray, J., Hein, S., Ivers, T., Le Gresley, E., Linger, R., Kasanicki, M., King, R., Kingston, N., Meloy, S., Moulton, A., Muldoon, F., Ovington, N., Papadia, S., Penkett, C.J., Phelan, I., Ranganath, V., Paraschiv, R., Sage, A., Sambrook, J., Scholtes, I., Schon, K., Stark, H., Stirrups, K.E., Townsend, P., Walker, N., Webster, J., Butlertanaka, E.P., Tanaka, Y.L., Ito, J., Uriu, K., Kosugi, Y., Suganami, M., Oide, A., Yokoyama, M., Chiba, M., Motozono, C., Nasser, H., Shimizu, R., Kitazato, K., Hasebe, H., Irie, T., Nakagawa, S., Wu, J., Takahashi, M., Fukuhara, T., Shimizu, K., Tsushima, K., Kubo, H., Kazuma, Y., Nomura, R., Horisawa, Y., Nagata, K., Kawai, Y., Yanagida, Y., Tashiro, Y., Tokunaga, K., Ozono, S., Kawabata, R., Morizako, N., Sadamasu, K., Asakura, H., Nagashima, M., Yoshimura, K., Cárdenas, P., Muñoz, E., Barragan, V., Márquez, S., Prado-Vivar, B., Becerra-Wong, M., Caravajal, M., Trueba, G., Rojas-Silva, P., Grunauer, M., Gutierrez, B., Guadalupe, J.J., Fernández-Cadena, J.C., Andrade-Molina, D., Baldeon, M., Pinos, A., Bowen, J.E., Joshi, A., Walls, A.C., Jackson, L., Martin, D., Smith, K.G.C., Bradley, J., Briggs, J.A.G., Choi, J., Madissoon, E., Meyer, K.B., Mlcochova, P., Ceron-Gutierrez, L., Doffinger, R., Teichmann, S.A., Fisher, A.J., Pizzuto, M.S., de Marco, A., Corti, D., Hosmillo, M., Lee, J.H., James, L.C., Thukral, L., Veesler, D., Sigal, A., Sampaziotis, F., Goodfellow, I.G., Matheson, N.J., Sato, K., Gupta, R.K. Altered TMPRSS2 usage by SARS-CoV-2 Omicron impacts infectivity and fusogenicity. Nature 603, 706–714 (2022). https://doi.org/10.1038/s41586-022-04474-x
• A. Carrazco-Montalvo, I. Armendáriz-Castillo, C.L. Tello, D. Morales, R. Armas-Gonzalez, D. Guizado-Herrera, A. León-Sosa, D. Ramos-Sarmiento, B. Fuertes, P. Cárdenas, S. Márquez, B. Prado-Vivar, J.J. Guadalupe, B. Gutiérrez, M.B. Wong, M. Grunauer, G. Trueba, P. Rojas-Silva, V. Barragán, L. Patino, First detection of SARS-CoV-2 variant B.1.1.529 (Omicron) in Ecuador. New Microbes and New Infections, Volume 45, 2022, 100951, https://doi.org/10.1016/j.nmni.2022.100951.

→ 2021

• Barreiro-Costa O, Morales-Noboa G, Rojas-Silva P, Lara-Barba E, Santamaría-Aguirre J, Bailón-Moscoso N, Romero-Benavides JC, Herrera A, Cueva C, Ron-Garrido L, Poveda A, Heredia-Moya J. Synthesis and Evaluation of Biological Activities of Bis (spiropyrazolone) cyclopropanes: A Potential Application against Leishmaniasis. Molecules. 2021 Aug 17;26(16):4960. doi: 10.3390/molecules26164960. PMID: 34443548; PMCID: PMC8398714.
• Bernardo Gutierrez, Sully Márquez, Belén Prado-Vivar, Mónica Becerra-Wong, Juan José Guadalupe, Darlan Da Silva Candido, Juan Carlos Fernandez-Cadena, Gabriel Morey-Leon, Rubén Armas-Gonzalez, Derly Madeleiny Andrade-Molina, Alfredo Bruno, Domenica De Mora, Maritza Olmedo, Denisse Portugal, Manuel Gonzalez, Alberto Orlando, Jan Felix Drexler, Andres Moreira-Soto, Anna-Lena Sander, Sebastian Brünink, Arne Kühne, Leandro Patiño, Andrés Carrazco-Montalvo, Orson Mestanza, Jeannete Zurita, Gabriela Sevillano, Louis Du Plessis, John T McCrone, Josefina Coloma, Gabriel Trueba, Verónica Barragán, Patricio Rojas-Silva, Michelle Grunauer, Moritz U G Kraemer, Nuno R Faria, Marina Escalera-Zamudio, Oliver G Pybus, Paúl Cárdenas. Genomic epidemiology of SARS-CoV-2 transmission lineages in Ecuador. Virus evolution 2021 7(2), https://doi.org/10.1093/ve/veab051
• Egas D, Guadalupe JJ, Prado-Vivar B, Becerra-Wong M, Márquez S, Castillo S, Latta J, Rodriguez F, Escorza G, Trueba G, Grunauer M, Barragán V, Rojas-Silva P, Cárdenas P. SARS-CoV-2 detection and sequencing in heart tissue associated with myocarditis and persistent arrhythmia: A case report. IDCases 2021;25:e01187. doi: 10.1016/j.idcr.2021.e01187. Epub 2021 Jun 11. PMID: 34136351; PMCID: PMC8192838.
• Prado-Vivar B, Becerra-Wong M, Guadalupe JJ, Márquez S, Gutierrez B, Rojas-Silva P, Grunauer M, Trueba G, Barragán V, Cárdenas P. A case of SARS-CoV-2 reinfection in Ecuador. Lancet Infect Dis. 2021 Jun;21(6):e142. doi: 10.1016/S1473-3099(20)30910-5. Epub 2020 Nov 23. PMID: 33242475; PMCID: PMC7833993.

→ 2020

• Sully Márquez, Belén Prado-Vivar, Juan José Guadalupe, Bernardo Gutierrez, Mónica Becerra-Wong, Manuel Jibaja, Milton Tobar, Verónica Barragán, Patricio Rojas-Silva, Josefina Coloma, Gabriel Trueba, Michelle Grunauer, Paúl Cárdenas. Metagenome of a Bronchoalveolar Lavage Fluid Sample from a Confirmed COVID-19 Case in Quito, Ecuador, Obtained Using Oxford Nanopore MinION Technology. Microbiology Resource Announcements Oct 2020, 9 (41) e00996-20; DOI: 10.1128/MRA.00996-20
• Konno Y, Kimura I, Uriu K, Fukushi M, Irie T, Koyanagi Y, Sauter D, Gifford RJ; USFQ-COVID19 Consortium, Nakagawa S, Sato K. SARS-CoV-2 ORF3b Is a Potent Interferon Antagonist Whose Activity Is Increased by a Naturally Occurring Elongation Variant. Cell Rep. Sep 22;32(12):108185. doi: 10.1016/j.celrep.2020.108185. Epub 2020 Sep 4. PMID: 32941788.

→ 2019

• Rommy Teran R, Guevara R, Mora J, Dobronski L, Barreiro-Costa O, Beske T, Pérez-Barrera J, Araya-Maturana R, Rojas-Silva P, Poveda A, Heredia-Moya J. Characterization of Antimicrobial, Antioxidant, and Leishmanicidal Activities of Schiff Base Derivatives of 4-Aminoantipyrine. Molecules 24, 2696. doi:10.3390/molecules24152696

→ 2018

• High Prevalence of Extended-Spectrum Beta-Lactamase CTX-M–Producing Escherichia coli in Small-Scale Poultry Farming in Rural Ecuador
  Hayden D. Hedman, Joseph N. S. Eisenberg, Karla A. Vasco, Christopher N. Blair, Gabriel Trueba, Veronica J. Berrocal and Lixin Zhang
  Publisher: The American Society of Tropical Medicine and Hygiene
  Source: The American Journal of Tropical Medicine and Hygiene
  Available online: 19 November 2018
  Document Type: Research Article
  DOI: https://doi.org/10.4269/ajtmh.18-0173
• Locals Get Travelers’ Diarrhea Too: Risk factors for diarrheal illness and pathogenic E. coli infection across an urban‐rural gradient in Ecuador
  Shanon M. Smith, Lorena Montero, Maritza Paez, Estefania Ortega, Eric Hall, Kate Bohnert, Xavier Sanchez, Edison Puebla, Pablo Endara, William Cevallos, Gabriel Trueba, Karen Levy
  First published: 16 November 2018
  https://doi.org/10.1111/tmi.13183
  This article has been accepted for publication and undergone full peer review but has not been through the copyediting, typesetting, pagination and proofreading process, which may lead to differences between this version and the Version of Record. Please cite this article as doi: 10.1111/tmi.13183
• Antibiotic Resistome Associated with Smallscale Poultry Production in Rural Ecuador.
  Xueping Guo, Robert D. Stedtfeld, Hayden Hedman, Joseph N.S.Eisenberg,Gabriel Trueba, Daqiang Yin, James M. Tiedje, and Lixin Zhang.
  Environ. Sci. Technol., Just Accepted Manuscript. DOI: 10.1021/acs.est.8b01667. Publication Date (Web): 26 Jun 2018.
  Downloaded from http://pubs.acs.org on June 27, 2018
• The geospatial relationship of pterygium and senile cataract to ambient solar ultraviolet in tropical Ecuador. 2018
  Daniel R. Garzon-Chavez, Emmanuelle Quentin, Simone Lee Harrison, Alfio Parisi, Harry J. Butler and Nathan Downs
  http://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2018/pp/c8pp00023a#!divAbstract
• Potential Zoonotic Transmission of Giardia duodenalis in Semi-rural Communities Near Quito, Ecuador. 2018
  Marysol Sarzosa1, Jay P. Graham2, Liseth Salinas1, Gabriel Trueba1
  http://www.jarvm.com/articles/Vol16Iss1/Vol16%20Iss1%20Trueba.pdf
• Bacterial identification of the vaginal microbiota in Ecuadorian pregnant teenagers: an exploratory analysis. 2018
  Ana María Salinas1, Verónica Gabriela Osorio1, Pablo Francisco Endara1,2, Eduardo Ramiro Salazar3, Gabriela Piedad Vasco1,3, Sandra Guadalupe Vivero3, Antonio Machado
  https://peerj.com/articles/4317/
• Isolation of Oropouche Virus from Febrile Patient, Ecuador. 2018
  Emma L. Wise, Steven T. Pullan, Sully Márquez, Verónica Paz, Juan D. Mosquera, Sonia Zapata, Simon K. Jackson, Gyorgy Fejer, Gabriel Trueba, and Christopher H. Logue
  https://wwwnc.cdc.gov/eid/article/24/5/17-1569_article
• Changes in dominant Escherichia coli and antimicrobial resistance after 24 hr in fecal matter. 2018
  Sofía Barrera, Paul Cardenas, Jay P. Graham, Gabriel Trueba.
  https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/mbo3.643

→ 2017

• Multiplex Peptide Nucleic Acid Fluorescence In Situ Hybridization (PNA-FISH) for Diagnosis of Bacterial Vaginosis. 2017
  Machado A1, Cerca N1
  https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-4939-7037-7_13
• Small-Scale Food Animal Production and Antimicrobial Resistance: Mountain, Molehill, or Something in-between? 2017
  Jay P. Graham1 Joseph N.S. Eisenberg,2 Gabriel Trueba,3 Lixin Zhang,4,5 and Timothy J. Johnson6
  https://ehp.niehs.nih.gov/ehp2116/
• Molecular phylogeny of 42 species of Culicoides (Diptera, Ceratopogonidae) from three continents. 2017
  Denis Augot, Bruno Mathieu, Leila Hadj-Henni, Véronique Barriel, Sonia Zapata Mena, Sylvia Smolis, Darine Slama, Fano José Randrianambinintsoa, Gabriel Trueba, Matthieu Kaltenbach, Nil Rahola, and Jérôme Depaquit
  https://www.researchgate.net/publication/317835697_Molecular_phylogeny_of_42_species_of_Culicoides_Diptera_Ceratopogonidae_from_three_continents

→ 2016

• First Complete Genome Sequences of Zika Virus Isolated from Febrile Patient Sera in Ecuador. 2016
  S. Márquez, a J. Carrera, a S. T. Pullan,b K. Lewandowski,K V. Paz,c N. Loman,d J. Quick,d D. Bonsall,e R. Powell,f J. Thézé,g O. G. Pybus,g P. Klenerman, e J. Eisenberg,h J. Coloma,i M. W. Carroll,b G. Trueba,a C. H. Loguea,b
  http://evolve.zoo.ox.ac.uk/Evolve/Oliver_Pybus_files/GenomeSequencesOfZIKVfromEcuador.pdf
• Bacteria associated with human saliva are major microbial components of Ecuadorian indigenous beers (chicha). 2016
  Ana L. Freire, Sonia Zapata, Juan Mosquera, Maria Lorena Mejia and Gabriel Trueba
  https://www.researchgate.net/publication/301688138_Bacteria_associated_with_human_saliva_are_major_microbial_components_of_Ecuadorian_indigenous_beers_chicha
• Antibiotic Resistance in Animal and Environmental Samples Associated with Small-Scale Poultry Farming in Northwestern Ecuador. 2016
  Nikolay P. Braykov,a Joseph N. S. Eisenberg,b Marissa Grossman,a Lixin Zhang,c,d Karla Vasco,e William Cevallos,e,f Diana Muñoz,e Andrés Acevedo,e Kara A. Moser,b Carl F. Marrs,b Betsy Foxman,b James Trostle,g Gabriel Trueba,e Karen Levy
  http://msphere.asm.org/content/msph/1/1/e00021-15.full.pdf
• Detection of Zoonotic Enteropathogens in Children and Domestic Animals in a Semirural Community in Ecuador. 2016
  Karla Vascoa, Jay P. Grahamb and Gabriel Truebaa
  http://aem.asm.org/content/82/14/4218.abstract
• Draft genome sequence of the first pathogenic Leptospira isolates from Ecuador. 2016
  Veronica Barragan, Jason W. Sahl, Kristin Wiggins, Jorge Chiriboga, Ana Salinas, Nancy E. Cantos, Mariana N. Loor, Bertha I. Intriago, Melba Morales, Gabriel Trueba, Talima Pearson
  https://nau.pure.elsevier.com/en/publications/draft-genome-sequence-of-the-first-pathogenic-leptospira-isolates

→ 2015

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  Machado A1, Castro J1, Cereija T1, Almeida C1, Cerca N1.
  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25737820
• Effects of Selection Pressure and Genetic Association on the Relationship between Antibiotic Resistance and Virulence in Escherichia coli. 2015
  Lixin Zhanga*, Karen Levyb, Gabriel Truebac, William Cevallosd, James Trostlee, Betsy Foxmana, Carl F. Marrsa and Joseph N. S. Eisenberga
  http://aac.asm.org/content/59/11/6733.full

→ Años anteriores

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• Trueba, G. et al. Detection of Fasciola hepatica infection in a community located in the Ecuadorian Andes. Am. J. Trop. Med. Hyg. 62, 518 (2000)

VIROLOGY, AN INTERACTIVE GUIDE

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University of Michigan 
País: Estados Unidos.
Tipo de Cooperación: Financiera.

Northern Arizona University 
País: Estados Unidos.
Tipo de Cooperación: Financiera, académica e investigación.

The George Washington University 
País: Estados Unidos.
Tipo de Cooperación: Financiera, académica e investigación.

Emory University 
País: Estados Unidos.
Tipo de Cooperación: Financiera, académica e investigación.

Université de Reims Champagne-Ardenne 
País: Francia.
Tipo de Cooperación: Financiera, académica e investigación.

Universidad Central del Ecuador 
País: Ecuador.
Tipo de Cooperación: Investigación.

University of California 
País: Estados Unidos
Tipo de Cooperación: Financiera, académica e investigación.

Royal Tropical Institute 
País: Estados Unidos.
Tipo de Cooperación: Investigación.

Instituto Nacional de Investigación en Salud Pública – INSPI 
País: Ecuador.
Tipo de Cooperación: Investigación.

Parque Nacional Galápagos. 
País: Ecuador.
Tipo de Cooperación: Investigación.

Universidad Nacional de Misiones. 
País: Argentina.
Tipo de Cooperación: Investigación.

Universidad de Sao Paulo. 
País: Brasil.
Tipo de Cooperación: Investigación.

Universidad Politécnica Salesiana. 
País: Ecuador.
Tipo de Cooperación: Investigación.

University of Southern Florida. 
País: Estados Unidos.
Tipo de Cooperación: Investigación.

VIROLOGY, AN INTERACTIVE GUIDE

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Eventos realizados

2017

Workshop 2: Primers design, in silico validation and PCR troubleshooting

Este taller es una breve capacitación al diseño de primers, utilizando programas bioinformáticos totalmente gratis y pretende dar una orientación a aquellas personas que están incursionando por primera vez en esta amplísima disciplina que es la Bioinformática.

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Workshop 3: Primers design, in silico validation and PCR troubleshooting

Este taller es una breve capacitación al diseño de primers, utilizando programas bioinformáticos totalmente gratis y pretende dar una orientación a aquellas personas que están incursionando por primera vez en esta amplísima disciplina que es la Bioinformática

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2016

FISH Methodology, probe design and practical study case

La Hibridación In Situ Fluorescente (FISH) es una técnica molecular que permite localizar un determinado fragmento de la secuencia de los ácidos nucleicos y pone de manifiesto la presencia o ausencia de secuencias génicas específicas.

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Primers design, in silico validation and PCR troubleshooting

La reacción en cadena de la polimerasa (del inglés PCR) tiene muchas aplicaciones en biología molecular, microbiología, medicina y biotecnología. Todas estas aplicaciones dependen del empleo de parejas de cebadores o primers, que sirven de puntos de.

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International Symposium On Phlebotamine Sandflies

ISOPS started as an opportunity to gather scientist from different cointries to discuss researsh findings in Phlebotamine sandflies. The first symposium was held in Rome, in 1991, and for the tenth edition, Ecuador was chosen as venue.

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Congresos 2018

II Congreso de Microbiología de la USFQ 2018

El Congreso busca exponer estudios de investigación de los distintos microorganismos, sus interacciones con el medio ambiente, la salud y el sector industrial. Busca promover también futuras colaboraciones de investigación en las áreas aplicadas de Microbiología en Ecuador, un país con la mayor diversidad biológica en el mundo.

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Congresos 2016

I Congreso de Microbiología de la USFQ 2016

El Congreso busca exponer estudios de investigación de los distintos microorganismos, sus interacciones con el medio ambiente, la salud y el sector industrial. Busca promover también futuras colaboraciones de investigación en las áreas aplicadas de Microbiología en Ecuador.

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Estudiantes de maestría

Santiago Xavier Naranjo Rivadeneira

Título: Identificación de los virus de EHDV (Epizootic hemorrhagic disease virus) y BTV (Blue Tongue Virus) en Culicoides insignis
Tutor: Sonia Zapata
Las enfermedades causadas por orbivirus tales como lengua azul y enfermedad epizoótica hemorrágica ocasionan pérdidas económicas importantes en ganadería y producción animal. La evidencia sugiere que C. insignis podría ser el vector de los orbivirus EHDV y BTV en América, por lo tanto, se requiere confirmar la presencia de estos virus en esta especie y otras relacionadas

Andrea Macías Matamoros

Título: Estudio de la bioactividad antiparasitaria de productos naturales obtenidos de fuentes biológicas del Ecuador
Tutor: Patricio Rojas Silva
El Ecuador posee una alta diversidad de especies biológicas que necesitan ser estudiadas para comprender su bioactividad. Con la obtención de extractos naturales se espera conocer sus efectos, y proponer nuevas opciones para el descubrimiento de nuevos agentes quimioterapéuticos para destinarlas a enfermedades parasitaria

Belén Rebeca Cortéz Zambrano

Título: Estudio Piloto de resistencia a Antibióticos y Metales Pesados
Tutor: Gabriel Trueba
El estudio consiste en la selección de bacterias resistentes a 10 ppm de mercurio provenientes de filtración de agua de ríos con presencia de minería ilegal. Dentro de los estudios moleculares, se realiza la amplificación del gen merA y 16S para confirmar la resistencia al mercurio y caracterizar a los aislados. Finalmente, la determinación del perfil de resistencia a 12 antibióticos pertenecientes a diferentes clases.

Viviana Atalía Albán Marañón

Título: Identificación de patógenos zoonóticos en muestras de animales domésticos en la provincia de Esmeraldas.
Tutor: Gabriel Trueba
Estudio piloto parte del Proyecto ECoMID (Enteropatógenos, Crecimiento, Microbioma y Diarrea) para determinar la frecuencia de Salmonella spp., Campylobacter spp., Cryptosporidium spp., Escherichia coli EPEC and Escherichia coli STEC como patógenos zoonóticos, utilizando la técnica de PCR en tiempo real cuantitativa a partir de muestras de heces de animales en un gradiente urbano rural en la provincia de Esmeraldas.

Carolina Guevara

Título: Caracterización de la microbiota intestinal en una cohorte con déficit del receptor de la hormona de crecimiento (GHRD) en la provincia del Oro
Tutor: Enrique Terán
Estudio en el que se caracterizara la composición de la microbiota intestinal en una cohorte de sujetos con (GHRD) y en sus familiares pareados por sexo y edad. Estableceremos las características de la microbiota y las relacionaremos con el fenotipo metabólico de los sujetos en ambas cohortes.

Stuart Torres

Título: Aislamiento e identificación de fagos líticos para Salmonella entérica
Tutor: Sonia Zapata
La Salmonelosis continúa siendo uno de los mayores problemas de salud pública a nivel mundial incluyendo el Ecuador. Se espera obtener un coctel de bacteriófagos específicos para varios serotipos infecciosos de Salmonella entérica, mediante aislamiento de bacteriófagos únicos, su identificación mediante técnicas moleculares y de serología y su posterior uso en conjunto con un coctel de otros bacteriófagos igualmente aislados e identificados.

Paula Lasso

Título: Formation and characterization of mixed biofilms of Listeria innocua
Tutor: Antonio Machado
Listeria innocua biofilms have been detected on food processing plants surfaces although it usually coexists with other potential or opportunistic pathogens (such as, Listeria monocytogenes, Staphyloccocus aureus or even Candida albicans). However, little is still known about L. innocua and its interactions as mixed biofilm formation with other microorganisms. Therefore, our main goal is to study and to understand the dynamic of single and mixed biofilms from L. innocua, using classic and molecular methodologies.

María Belén Atiencia Carrera

Título: Formation and characterization of Candida albicans biofilms
Tutor: Antonio Machado
Candida albicans biofilms have been detected on several serious infections (such as, oral, genital and systemic fungal infections). Although Candida albicans usually coexists as commensal or opportunistic microorganism on human microbiome in a planktonic form, the presence of biofilms can result in serious problems due to their resistance to antimicrobial agents. So, our main goal is to study and to understand the dynamic of biofilms from several strains of C. albicans, using classic and molecular methodologies.

Valentina Arévalo Granda

Título: Impacto del polimorfismo del gen ABCC11 en el microbioma de la piel de seres humanos
Tutor: Paúl Cárdenas
El efecto del polimorfismo del gen de la piel en el humano denominado ABCC11 puede tener un efecto en el microbioma bacteriano de la piel, que a su vez tendría una influencia en la afinidad de algunas personas para ser blanco de picaduras de mosquitos, por esta razón se está realizando un estudio piloto en personas de la sierra y costa del Ecuador.

Johanna Carolina Molina Tabares

Título: Determinación del posible vector del virus de Oropuche en Ecuador.
Tutor: Sonia Zapata
El virus de Oropouche (OROV) perteneciente a la familia Bunyaviridae es el agente causal de una enfermedad febril aguda autolimitada, la fiebre de Oropouche, transmitida por mosquitos. Los vectores implicados en las transmisiones en el ciclo selvático son los mosquitos Aedes y Culex, mientras que en el ciclo urbano es Culicoides paraensis; por lo que en este estudio se pretende determinar el posible vector biológico en Ecuador mediante el uso de qRT-PCR a partir de Culicoides y Culex spp. colectados en la provincia de Esmeraldas en mayo de 2019.

Estudiantes de doctorado

Sara Gabriela Cifuentes Rodríguez

Título: Caracterización y Análisis del Resistoma del Intestino Humano en Presencia de Probióticos
Tutor: Paúl Cárdenas
Me interesa el estudio del microbioma por su rol en la salud humana y particularmente porque es un reservorio importante de genes de resistencia a los antibióticos en presencia o en ausencia de presión selectiva antibiótica. Mi objetivo es entender, usando herramientas de metagenómica y bioinformática, cuál es el alcance de esta reserva de resistencia y si los probióticos pueden modificarla positivamente.

Ana Yulieth Cárdenas Orrego

Título: Wastewater treatment with native microalgal-bacterial consortia from the Ecuadorian Amazon, Andean Region and Galapagos Islands.
Tutor: Valeria Ochoa-Herrera
The discharge of untreated wastewater effluents, in Ecuador, has become a serious environmental concern. Microalgae-bacteria consortia hold a great potential for wastewater bioremediation as a consequence of their synergistic capacity to degrade organic matter and assimilate nutrients. The objectives of this study are to i) evaluate the elimination of organic matter and nutrients present in the raw wastewater from USFQ by native microalgae-bacteria consortia from the Ecuadorian Amazon, the Andean Region, and the Galapagos Islands and ii) conduct molecular studies of the structure and diversity of the microbial community responsible for the biodegradation process.

Liseth Salinas

Título: Transferencia de resistencia a antibióticos entre cepas de E. coli aisladas de animales domésticos y humanos.
Tutor: Gabriel Trueba
La investigación está enfocada en la transferencia horizontal de genes de resistencia a antibióticos en E. coli. Los principales objetivos son entender el comportamiento de plásmidos y otros elementos genéticos móviles asociados a genes de resistencia a antimicrobianos, así como determinar relaciones filogenéticas existentes entre estas bacterias, aisladas de animales domésticos y humanos.

María Fernanda Zurita

Título: Composición del microbioma pulmonar de pacientes con neumonía que son positivos para VIH.
Tutor: Enrique Terán
El VIH altera el sistema inmunológico. Las neumonías causadas por microorganismos como M. tuberculosis, H. influenzae, P. jirovecci, H. capsulatum, son frecuentes y el microbioma respiratorio junto a los tratamientos antiretrovirales tienen un rol inmunomodulatorio. Este estudio se enfoca en identificar y cuantificar los cambios composicionales y funcionales del microbioma respiratorio en la fase de portador y en la fase SIDA considerando el tratamiento.

María Aracely Zambrano Romero

Título: Sistema integral de tratamiento de drenajes ácidos de roca provenientes de las actividades de minería metálica en el Ecuador.
Tutor: Valeria Ochoa-Herrera, PhD.
Nuestro proyecto de investigación proporciona una perspectiva integral y multidisciplinaria al tratamiento de drenajes ácidos de roca producidos por las actividades de minería metálica en el Ecuador. Mediante modernas técnicas moleculares estudiamos la estructura, dinámica y evolución de las comunidades microbianas y promovemos la biorremediación a partir de inóculos nativos.

Ligia Elizabeth Luna Jarrín

Título: En búsqueda de dos zoonosis asociadas a la pobreza en diferentes provincias del Ecuador.
Tutor: Verónica Barragán
Leptospirosis es una enfermedad zoonótica que tiene una amplia distribución a nivel mundial, (1,2). Siendo las regiones tropicales y subtropicales las de mayor incidencia de casos y brotes (3,4). Estudios han demostrado que una de las mayores fuentes de transmisión de Leptospira spp. son ambientes contaminados con orina de mamíferos infectados, además estudios realizados de muestras ambientales han revelado la gran diversidad de Leptospira identificando nuevas especies potencialmente infecciosas (5). En este contexto nuestra investigación busca estudiar espacios peri domésticos y sus animales como factor de riesgo de transmisión de leptospirosis y conocer los genotipos circulantes en diferentes provincias del Ecuador.

Teresa Guerrero

Título: Bacteriófagos como alternativa al uso de antibióticos en la crianza de aves de corral.
Tutor: Sonia Zapata
La resistencia bacteriana a los antibióticos constituye un problema emergente a nivel mundial, por lo que el empleo de bacteriófagos constituye una alternativa en la producción animal. Mi proyecto se enfoca en el aislamiento y caracterización de fagos que controlan Salmonella en granjas avícolas.

Sully Estefanía Márquez Aguilar

Título: Co-circulación de Zika y Dengue bajo cambio ambiental y urbanización: un estudio longitudinal en Esmeraldas (2018-2023).
Tutor: Gabriel Trueba
Recientemente, se ha observado la expansión de virus transmitidos por mosquitos (Dengue, Chikungunya, Zika, Mayaro y Oropuche) y el re-aparecimiento de otros virus que se pensaban erradicados. Las razones asociadas a esta expansión viral y reaparecimiento están relacionadas con factores tales como la deforestación, la urbanización, el cambio climático y viajes internacionales, es por ello que el proyecto consiste en la detección e identificación de arbovirus en muestras de pacientes febriles y estudiar la co-circulación de los mismos en la provincia de Esmeraldas por 4 años.

Lorena Montero

Título: Ecuadorian produce: an important source of antibiotic resistant bacteria
Tutor: Gabriel Trueba
La transmisión de bacterias (genes) resistentes a los antimicrobianos es uno de los principales problemas de salud pública a nivel mundial. La falta de tratamiento de aguas servidas en el Ecuador permite que las bacterias intestinales humanas estén presentes en altas cantidades en ríos y canales de riego. Algunas bacterias intestinales como E. coli pueden sobrevivir en el medio ambiente fuera del hospedador, son muy activas en la transmisión de genes de resistencia a los antibióticos y pueden volverse patógenas para los humanos. Nuestro objetivo es estudiar la presencia de E. coli con genes de ß-lactamasa de espectro extendido en vegetales vendidos en Quito

El Instituto de Microbiología tiene intereses de investigación en distintos campos: Medicina, Veterinaria, Agricultura, Industria Alimenticia, Industria Farmacéutica, Bioremediación, Biocombustibles, Industria, Silvicultura, Pesca, entre otros.

María Natalia Chamorro Sanmiguel
Asistente Administrativa

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