FISH Methodology, probe design and practical study case

Workshop 2 - FISH Methodology, probe design and practical study case

Temática

• Principios de la Metodología FISH (Fluorescence in situ hybridization)
• Aplicación Práctica: caso de estudio
• Exámen de Capacitación

Descripción del taller

La Hibridación In Situ Fluorescente (FISH) es una técnica molecular que permite localizar un determinado fragmento de la secuencia de los ácidos nucleicos y pone de manifiesto la presencia o ausencia de secuencias génicas específicas. Se puede aplicar sobre muestras celulares de microrganismos o directamente en cortes de tejidos en estudio. La hibridación in situ toma como fundamento la complementariedad de los ácidos nucleicos, la cual puede ser DNA y/o RNA, a través de puentes de hidrógeno formados entre las bases: adenina–timina (DNA) o uracilo (RNA) y citosina-guanina (DNA y RNA).

En el área médica, FISH es una técnica que detecta secuencias de ácidos nucleicos en células, cromosomas o tejidos preservados. La detección in situ provee una visualización directa de la localización espacial de secuencias específicas que es crucial para dilucidar la organización y función génica, por lo que el método de hibridación in situ se ha convertido en una técnica importante en diversos campos, incluyendo diagnóstico de rearreglos cromosomales, detección de infecciones virales y análisis de la función génica durante el desarrollo embrionario. Mientras que en microbiología, FISH es una técnica que emplea sondas de oligonucleótidos marcadas con fluorocromos las cuales van dirigidas hacia secuencias específicas del ácido ribonucleico ribosomal (ARNr), lo que permite la identificación rápida y específica de células microbianas ya sea que estén como células individuales o se encuentren agrupadas en su ambiente natural. El conocimiento de la composición y distribución de los microorganismos en los hábitats naturales, proporciona un soporte sólido para comprender la interacción entre las diversas especies que componen el micro hábitat.

El objetivo de este taller es presentar la metodología de hibridación, como construir sondas de fluorescencia, los tipos de marcadores fluorescentes empleados hoy en día y como planificar un protocolo con esta técnica a la muestra deseada en estudio. También se pretende dar una orientación a aquellas personas que están incursionando por primera vez en esta amplísima disciplina que es la Bioinformática. En la parte práctica del taller, se realizará un experimento en biopsias gástricas para la detección de bacterias Helicobacter pylori y su resistencia antimicrobiana por múltiples sondas de fluorescencia.

Este evento tiene como destino los estudiantes, profesionales (Institutos, empresas y hospitales públicos o privados) y mismo profesores envueltos en las áreas de ciencias biológicas/microbiología/Biotecnología/medicina y otras áreas similares que trabajan con ADN, detección de microrganismos o identificación de genes en cualquier tipo de organismo vivo.

Profesor del taller

Antonio Machado

Antonio Machado
Profesor de Microbiología Patógena e Inmunología
Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales

Telf: (+593 2) 297-1700, ext. 1426
E-mail: amachado@usfq.edu.ec

Estudios: - Licenciado en Bioquímica, Universidade de Évora, Portugal y Évora
- Toxicología Clínica y Forense(Maestría), Portugal y Porto (Maestría), Universidade do Porto (Maestría)
- PhD en Ingeniería Biomédica (Doctorado), Portugal y Braga (Doctorado),Universidade do Minho (Doctorado)

 

Intereses: - Diagnóstico de patógenos
- Desarrollo de métodos de diagnóstico microbiano
- Caracterización de la patogenicidad y virulencia de enfermedades infecciosas
- Análisis genómico y fenotipo de biofilms microbianos

Cronograma

 

 Sábado 01 de octubre

Domingo 02 de octubre

Lunes 3 de octubre

9am-10am

Principios de la metodología FISH (Fluorescence in situ hybridization)
E202 TENTATIVAMENTE
Practical application: case study
Laboratorio Maxwell-011
>Examen de capacitación
E202 TENTATIVAMENTE 

10am-11am

11am-12am

 

12-am-1pm

 

 

1pm-2pm

 

 

 

2pm-3pm

Probe Design and In Silico Validation
E202 TENTATIVAMENTE

 

 

3pm-4pm

 

 

4pm-5pm

 

 

Indispensable

• Conocimientos mínimos de Biología Molecular
• Microbiología
• Traer su propia laptop

Inversión:

200 USD Profesionales
100 USD Estudiantes
Incluye certificado y libros PDF de la especialidad

Inscripción

Datos para la Inscripción:
Nombre Cta.:
Universidad San Francisco de Quito
Banco Bolivariano - Cta. Cte. 1645003014
RUC 1791836154001
Enviar constancia de pago a: acoba@usfq.edu.ec

Contacto

Antonio Machado
Telf.: 297-1700 ext 1426
Email: amachado@usfq.edu.ec

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