Nuestros estudiantes

Estudiantes de maestría

Santiago Xavier Naranjo Rivadeneira

Título: Identificación de los virus de EHDV (Epizootic hemorrhagic disease virus) y BTV (Blue Tongue Virus) en Culicoides insignis
Tutor: Sonia Zapata
Las enfermedades causadas por orbivirus tales como lengua azul y enfermedad epizoótica hemorrágica ocasionan pérdidas económicas importantes en ganadería y producción animal. La evidencia sugiere que C. insignis podría ser el vector de los orbivirus EHDV y BTV en América, por lo tanto, se requiere confirmar la presencia de estos virus en esta especie y otras relacionadas

Andrea Macías Matamoros

Título: Estudio de la bioactividad antiparasitaria de productos naturales obtenidos de fuentes biológicas del Ecuador
Tutor: Patricio Rojas Silva
El Ecuador posee una alta diversidad de especies biológicas que necesitan ser estudiadas para comprender su bioactividad. Con la obtención de extractos naturales se espera conocer sus efectos, y proponer nuevas opciones para el descubrimiento de nuevos agentes quimioterapéuticos para destinarlas a enfermedades parasitaria

Belén Rebeca Cortéz Zambrano

Título: Estudio Piloto de resistencia a Antibióticos y Metales Pesados
Tutor: Gabriel Trueba
El estudio consiste en la selección de bacterias resistentes a 10 ppm de mercurio provenientes de filtración de agua de ríos con presencia de minería ilegal. Dentro de los estudios moleculares, se realiza la amplificación del gen merA y 16S para confirmar la resistencia al mercurio y caracterizar a los aislados. Finalmente, la determinación del perfil de resistencia a 12 antibióticos pertenecientes a diferentes clases.

Viviana Atalía Albán Marañón

Título: Identificación de patógenos zoonóticos en muestras de animales domésticos en la provincia de Esmeraldas.
Tutor: Gabriel Trueba
Estudio piloto parte del Proyecto ECoMID (Enteropatógenos, Crecimiento, Microbioma y Diarrea) para determinar la frecuencia de Salmonella spp., Campylobacter spp., Cryptosporidium spp., Escherichia coli EPEC and Escherichia coli STEC como patógenos zoonóticos, utilizando la técnica de PCR en tiempo real cuantitativa a partir de muestras de heces de animales en un gradiente urbano rural en la provincia de Esmeraldas.

Carolina Guevara

Título: Caracterización de la microbiota intestinal en una cohorte con déficit del receptor de la hormona de crecimiento (GHRD) en la provincia del Oro
Tutor: Enrique Terán
Estudio en el que se caracterizara la composición de la microbiota intestinal en una cohorte de sujetos con (GHRD) y en sus familiares pareados por sexo y edad. Estableceremos las características de la microbiota y las relacionaremos con el fenotipo metabólico de los sujetos en ambas cohortes.

Stuart Torres

Título: Aislamiento e identificación de fagos líticos para Salmonella entérica
Tutor: Sonia Zapata
La Salmonelosis continúa siendo uno de los mayores problemas de salud pública a nivel mundial incluyendo el Ecuador. Se espera obtener un coctel de bacteriófagos específicos para varios serotipos infecciosos de Salmonella entérica, mediante aislamiento de bacteriófagos únicos, su identificación mediante técnicas moleculares y de serología y su posterior uso en conjunto con un coctel de otros bacteriófagos igualmente aislados e identificados.

Paula Lasso

Título: Formation and characterization of mixed biofilms of Listeria innocua
Tutor: Antonio Machado
Listeria innocua biofilms have been detected on food processing plants surfaces although it usually coexists with other potential or opportunistic pathogens (such as, Listeria monocytogenes, Staphyloccocus aureus or even Candida albicans). However, little is still known about L. innocua and its interactions as mixed biofilm formation with other microorganisms. Therefore, our main goal is to study and to understand the dynamic of single and mixed biofilms from L. innocua, using classic and molecular methodologies.

María Belén Atiencia Carrera

Título: Formation and characterization of Candida albicans biofilms
Tutor: Antonio Machado
Candida albicans biofilms have been detected on several serious infections (such as, oral, genital and systemic fungal infections). Although Candida albicans usually coexists as commensal or opportunistic microorganism on human microbiome in a planktonic form, the presence of biofilms can result in serious problems due to their resistance to antimicrobial agents. So, our main goal is to study and to understand the dynamic of biofilms from several strains of C. albicans, using classic and molecular methodologies.

Valentina Arévalo Granda

Título: Impacto del polimorfismo del gen ABCC11 en el microbioma de la piel de seres humanos
Tutor: Paúl Cárdenas
El efecto del polimorfismo del gen de la piel en el humano denominado ABCC11 puede tener un efecto en el microbioma bacteriano de la piel, que a su vez tendría una influencia en la afinidad de algunas personas para ser blanco de picaduras de mosquitos, por esta razón se está realizando un estudio piloto en personas de la sierra y costa del Ecuador.

Johanna Carolina Molina Tabares

Título: Determinación del posible vector del virus de Oropuche en Ecuador.
Tutor: Sonia Zapata
El virus de Oropouche (OROV) perteneciente a la familia Bunyaviridae es el agente causal de una enfermedad febril aguda autolimitada, la fiebre de Oropouche, transmitida por mosquitos. Los vectores implicados en las transmisiones en el ciclo selvático son los mosquitos Aedes y Culex, mientras que en el ciclo urbano es Culicoides paraensis; por lo que en este estudio se pretende determinar el posible vector biológico en Ecuador mediante el uso de qRT-PCR a partir de Culicoides y Culex spp. colectados en la provincia de Esmeraldas en mayo de 2019.

Estudiantes de doctorado

Sara Gabriela Cifuentes Rodríguez

Título: Caracterización y Análisis del Resistoma del Intestino Humano en Presencia de Probióticos
Tutor: Paúl Cárdenas
Me interesa el estudio del microbioma por su rol en la salud humana y particularmente porque es un reservorio importante de genes de resistencia a los antibióticos en presencia o en ausencia de presión selectiva antibiótica. Mi objetivo es entender, usando herramientas de metagenómica y bioinformática, cuál es el alcance de esta reserva de resistencia y si los probióticos pueden modificarla positivamente.

Ana Yulieth Cárdenas Orrego

Título: Wastewater treatment with native microalgal-bacterial consortia from the Ecuadorian Amazon, Andean Region and Galapagos Islands.
Tutor: Valeria Ochoa
The discharge of untreated wastewater effluents, in Ecuador, has become a serious environmental concern. Microalgae-bacteria consortia hold a great potential for wastewater bioremediation as a consequence of their synergistic capacity to degrade organic matter and assimilate nutrients. The objectives of this study are to i) evaluate the elimination of organic matter and nutrients present in the raw wastewater from USFQ by native microalgae-bacteria consortia from the Ecuadorian Amazon, the Andean Region, and the Galapagos Islands and ii) conduct molecular studies of the structure and diversity of the microbial community responsible for the biodegradation process.

Liseth Salinas

Título: Transferencia de resistencia a antibióticos entre cepas de E. coli aisladas de animales domésticos y humanos.
Tutor: Gabriel Trueba
La investigación está enfocada en la transferencia horizontal de genes de resistencia a antibióticos en E. coli. Los principales objetivos son entender el comportamiento de plásmidos y otros elementos genéticos móviles asociados a genes de resistencia a antimicrobianos, así como determinar relaciones filogenéticas existentes entre estas bacterias, aisladas de animales domésticos y humanos.

María Fernanda Zurita

Título: Composición del microbioma pulmonar de pacientes con neumonía que son positivos para VIH.
Tutor: Enrique Terán
El VIH altera el sistema inmunológico. Las neumonías causadas por microorganismos como M. tuberculosis, H. influenzae, P. jirovecci, H. capsulatum, son frecuentes y el microbioma respiratorio junto a los tratamientos antiretrovirales tienen un rol inmunomodulatorio. Este estudio se enfoca en identificar y cuantificar los cambios composicionales y funcionales del microbioma respiratorio en la fase de portador y en la fase SIDA considerando el tratamiento.

María Aracely Zambrano Romero

Título: Sistema integral de tratamiento de drenajes ácidos de roca provenientes de las actividades de minería metálica en el Ecuador.
Tutor: Valeria Ochoa-Herrera, PhD.
Nuestro proyecto de investigación proporciona una perspectiva integral y multidisciplinaria al tratamiento de drenajes ácidos de roca producidos por las actividades de minería metálica en el Ecuador. Mediante modernas técnicas moleculares estudiamos la estructura, dinámica y evolución de las comunidades microbianas y promovemos la biorremediación a partir de inóculos nativos.

Ligia Elizabeth Luna Jarrín

Título: En búsqueda de dos zoonosis asociadas a la pobreza en diferentes provincias del Ecuador.
Tutor: Verónica Barragán
Leptospirosis es una enfermedad zoonótica que tiene una amplia distribución a nivel mundial, (1,2). Siendo las regiones tropicales y subtropicales las de mayor incidencia de casos y brotes (3,4). Estudios han demostrado que una de las mayores fuentes de transmisión de Leptospira spp. son ambientes contaminados con orina de mamíferos infectados, además estudios realizados de muestras ambientales han revelado la gran diversidad de Leptospira identificando nuevas especies potencialmente infecciosas (5). En este contexto nuestra investigación busca estudiar espacios peri domésticos y sus animales como factor de riesgo de transmisión de leptospirosis y conocer los genotipos circulantes en diferentes provincias del Ecuador.

Teresa Guerrero

Título: Bacteriófagos como alternativa al uso de antibióticos en la crianza de aves de corral.
Tutor: Sonia Zapata
La resistencia bacteriana a los antibióticos constituye un problema emergente a nivel mundial, por lo que el empleo de bacteriófagos constituye una alternativa en la producción animal. Mi proyecto se enfoca en el aislamiento y caracterización de fagos que controlan Salmonella en granjas avícolas.

Sully Estefanía Márquez Aguilar

Título: Co-circulación de Zika y Dengue bajo cambio ambiental y urbanización: un estudio longitudinal en Esmeraldas (2018-2023).
Tutor: Gabriel Trueba
Recientemente, se ha observado la expansión de virus transmitidos por mosquitos (Dengue, Chikungunya, Zika, Mayaro y Oropuche) y el re-aparecimiento de otros virus que se pensaban erradicados. Las razones asociadas a esta expansión viral y reaparecimiento están relacionadas con factores tales como la deforestación, la urbanización, el cambio climático y viajes internacionales, es por ello que el proyecto consiste en la detección e identificación de arbovirus en muestras de pacientes febriles y estudiar la co-circulación de los mismos en la provincia de Esmeraldas por 4 años.

Lorena Montero

Título: Ecuadorian produce: an important source of antibiotic resistant bacteria
Tutor: Gabriel Trueba
La transmisión de bacterias (genes) resistentes a los antimicrobianos es uno de los principales problemas de salud pública a nivel mundial. La falta de tratamiento de aguas servidas en el Ecuador permite que las bacterias intestinales humanas estén presentes en altas cantidades en ríos y canales de riego. Algunas bacterias intestinales como E. coli pueden sobrevivir en el medio ambiente fuera del hospedador, son muy activas en la transmisión de genes de resistencia a los antibióticos y pueden volverse patógenas para los humanos. Nuestro objetivo es estudiar la presencia de E. coli con genes de β-lactamasa de espectro extendido en vegetales vendidos en Quito