Proyecto Regulación Genética celular

Simulaciones con dinámica molecular (propiedades y estructura) de ADN no convencional.

El objetivo de este proyecto es caracterizar sistemas en los que existe evidencia de estructuras no convencionales de ADN in vitro exista o no evidencia concluyente de su existencia en sistemas biológicos pero cuyo estudio nos de caminos para explorar nuevos mecanismos de regulación genética y de la dinámica de los ácidos nucleicos. Por ejemplo estudiamos estructuras tipo cierre, secuencias que forman tales estructuras se han encontrado en orígenes de replicación de virus y bacterias. En este artículo se reporta la caracterización detallada a nivel atómico de ADN rico en Guaninas que forman estructuras tipo cierre (zipper). Para esto se utilizan métodos de modelación con mecánica molecular. Se construyeron modelos para las estructuras y se minimizaron, lo cual permitió su análisis vía mecánica molecular para entender los factores que determinan la estructura más estable. Se encontró por ejemplo que la presencia de iones con carga positiva cercanos a la región rica en Gs de las secuencias estudiadas es de importancia fundamental en la estabilidad de estos ensambles de ADN. En resumen, los resultados permiten mejorar la comprensión de este sistema a escala molecular.

Regulación Genética Celular

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