5to Simposio "Avances en el mundo de los Microbiomas" USFQ
Hace unos años surgió el concepto de microbioma, el cual se entiende como el conjunto de diversos tipos de microorganismos, sus características incluyendo su genoma, y las interacciones que establecen al coexistir dentro de un sistema compartido. Durante varios años, la ciencia, y en particular la investigación microbiológica, presentó limitaciones para acceder a ciertas áreas que no eran técnicamente alcanzables, no se comprendían en su totalidad, o incluso se desconocía su existencia.
Con el paso del tiempo, el desarrollo acelerado de la tecnología ha permitido superar muchas de estas limitaciones, posibilitando la exploración de aspectos previamente inaccesibles. Estos avances han abierto nuevas oportunidades para el estudio de los microbiomas, impulsando la expansión del conocimiento y dando lugar a nuevas ramas de investigación dentro de la microbiología.
Por la gran importancia del tema, y siguiendo las exitosas ediciones en 2018, 2019, y 2021, 2024, el Instituto de Microbiología del Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales de la Universidad San Francisco de Quito, extiende una cordial invitación a la quinta edición del Simposio Internacional “Avances en el mundo de los Microbiomas”, el mismo que se llevará a cabo en el campus Cumbayá de la Universidad San Francisco de Quito, el 11-12 de junio de 2026.
El propósito del Simposio es fomentar el crecimiento académico sobre el concepto de microbioma, definido como la totalidad de microorganismos, su material genético y las interacciones que se desarrollan en el espacio en donde viven. Sin duda, esta enorme cantidad de microorganismos con sus propias proteínas y rutas metabólicas afectan al metabolismo y a los procesos fisiológicos de humanos, animales y plantas, y los entornos naturales y (agro)ecosistemas que comparten entre ellos.
La temática especial de esta edición celebrativa tipo LUSTRUM será con un enfoque de "nuevas fronteras en investigaciones de microbiomas", entendidas como aquellas áreas emergentes de investigación que han sido posibles gracias a los avances recientes en tecnología y biología molecular.
Estas nuevas fronteras abarcan el estudio de comunidades microbianas previamente inaccesibles, mediante herramientas como la metagenómica, la metatranscriptómica y la metabolómica, las cuales permiten caracterizar la diversidad, función e interacciones de los microorganismos sin necesidad de cultivarlos de manera individual. A partir de estos enfoques, se ha logrado una comprensión más profunda del papel que desempeñan los microbiomas en la salud humana, animal, vegetal y ambiental, posicionándolos como un eje central para el desarrollo de soluciones innovadoras en áreas como la biotecnología, la agricultura sostenible, y la medicina.
El viernes 12 de junio de 2026, en el horario de 08:30 a 17:30, se ofrecerán charlas magistrales de modo presencial a cargo de expertos nacionales e internacionales en las temáticas de microbiomas de humanos, plantas, animales, y microbiomas ambientales. La mayoría de las charlas magistrales será en español.
Les pongo a su atención que el día anterior al simposio, el jueves 11 de junio, de nuevo ofreceremos varios talleres académicos relacionados a los estudios de microbiomas, por la popularidad y la gran acogida en eventos anteriores, como parte de las actividades del simposio. La asistencia a nuestros talleres esta incluido en las tarifas del congreso en modo presencial.
Si deseas participar desde el exterior, ofrecemos por primera vez la opción de asistir de manera virtual a las charlas magistrales del simposio del viernes 15 de noviembre, manejado por la plataforma ZOOM.
Les pongo a su atención que el día anterior al simposio, el jueves 14 de noviembre de 2024, ofreceremos varios talleres académicos relacionados a los microbiomas como parte de las actividades del simposio. La asistencia a nuestros talleres esta incluido en las tarifas del congreso del modo presencial.
Les invitamos a revisar la información en las secciones de esta página web oficial y contactarnos si tienen dudas o preguntas.
Les esperamos en junio como participante en esta nueva edición conmemorativa del primer LUSTRUM de nuestra serie de simposios.
Estamos encantados de darles la cordial bienvenida!
Expositores
Roberto Kolter
Professor of Microbiology (emeritus)
- Harvard Medical School, Boston, United States of America (USA)
- Past president of the American Society for Microbiology.
Charla Magistral: "Tierra: El Planeta de los Microorganismos"
E-mail: roberto_kolter@hms.harvard.edu
Website: https://gasp.med.harvard.edu/default.htm
Sarah E. Evans
Red Cedar Distinguished Associate Professor
- Kellogg Biological Station, Michigan State University, United States of America (USA)
Invited talk (in English): “To be announced”
E-mail: evanssa6@msu.edu
Website: https://saraheevanslab.weebly.com/
Santiago Zarate Baca
Coordinador de la Carrera de Biotecnología
- Universidad Técnica del Norte – UTN, Ibarra - Ecuador
Charla Magistral (ESP): Estudio del microbioma de suelo antartico presente en los alrededores de la Base Científica Ecuatoriana Pedro Vicente Maldonado.
E-mail: szarate@utn.edu.ec
Página web: https://biotecnologia.utn.edu.ec/?page_id=371
Stephen Sherwood
- Fundación EkoRural, Ecuador
- Lecturer and Researcher in “Knowledge, Technology and Innovation”
- Wageningen University, the Netherlands.
- Former Andes Regional Director for World Neighbors.
Charla Magistral (ESP): El manejo ecológico de suelos: Desde la nutrición de plantas a la rehabilitación de ecosistemas.
E-mail: stephen.sherwood@wur.nl
Pagina web: https://ekorural.org/about-ekorural/the-ekorural-team/
Lorena Mejía Castañeda
Instituto de Microbiología
- Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales (COCIBA) Universidad San Francisco de Quito – USFQ Ecuador
Charla Magistral (ESP): Vigilancia genómica de enfermedades transmitidas por alimentos como parte integral del concepto “One Health”
E-mail: mmejia@usfq.edu.ec
Pagina web: https://www.usfq.edu.ec/es/perfiles/maria-lorena-mejia-castaneda
Darío X. Ramírez-Villacis
Candidato PhD
- Utrecht University (UU), Netherlands Institute for Ecology (NIOO-KNAW), The Netherlands
Charla Magistral (ESP): A walk on the wild side: exploring the functional potential of Andean soil microbiomes to enhance tolerance of potato to late blight disease
E-mail: d.ramirez@nioo.knaw.nl
Pagina web: https://nioo.knaw.nl/en/employees/dario-x-ramirez-villacis
Paúl Cárdenas
Instituto de Microbiología
Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales (COCIBA)
Universidad San Francisco de Quito – USFQ
Ecuador
Charla Magistral (ESP): ”Estudios del microbioma humano en Ecuador”
E-mail: pacardenas@usfq.edu.ec
Pagina web: https://www.usfq.edu.ec/es/perfiles/paul-cardenas
Pieter van ’t Hof
Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales (COCIBA)
Universidad San Francisco de Quito – USFQ
Ecuador
Charla Magistral (ESP): ” Back to the Roots: Explorando el microbioma de la rizosfera de especies de tomates silvestres en su centro de origen en los Andes y las Islas Galápagos”
E-mail: pvanthof@usfq.edu.ec
Pagina web: https://www.usfq.edu.ec/es/perfiles/pieter-van-t-hof
Jessica Duchicela
Universidad de las Fuerzas Armadas (ESPE-IASA)
Ecuador
Taller Académico (ESP): "Explorando el Universo de las Micorrizas: Técnicas Avanzadas para el Aislamiento e Identificación de Esporas"
E-mail: jiduchicela@espe.edu.ec
Pagina web: https://www.researchgate.net/profile/Jessica-Duchicela
Iván Astudillo Estévez
Instituto de Microbiología
Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales (COCIBA)
Universidad San Francisco de Quito – USFQ
Ecuador
Taller Académico (ESP): “Del laboratorio al ordenador: Fundamentos para el análisis metataxonómico de secuencias para el estudio de comunidades microbianas”
E-mail: iastudilloe@estud.usfq.edu.ec
Pagina web: https://ec.linkedin.com/in/iastudillo-estevez
Samuel Cortese Mc Lean
DARWIN200 Leader
Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales (COCIBA)
Universidad San Francisco de Quito – USFQ
Ecuador
Taller Académico (ESP): “Experiencias & viewing videos de participación de Ecuador en la iniciativa global DARWIN200”
E-mail: scortese@estud.usfq.edu.ec
Pagina web: https://darwin200.com/leaderboard/samuel-cortese-mclean/
Organizadores
Registro
Todas las inscripciones para el Simposio y los Talleres Académicos se realizarán a partir del lunes 2 de marzo de 2026.
Tarifas Simposio & Talleres Académicos (Presencial)
- $30 Estudiantes & Comunidad USFQ
- $50 Alumni USFQ
- $80 Profesionales
Registro incluye:
Jueves 11 de junio (presencial)
- Talleres académicos
Viernes 12 de junio (presencial)
- Charlas magistrales & discusiones Q&A
- Acceso a WiFi gratis
- Coffee breaks
- Almuerzo ejecutivo
- Certificado virtual de participación
Programa - Talleres Académicos
| Programa (QUITO GMT -5) Jueves 14 de noviembre 2024 Modalidad: Presencial Lugar: Laboratorio Maxwell 008, USFQ Campus Santiago Gangotena, Cumbayá, Quito |
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|---|---|
| 10:00 – 12:00 | WORKSHOP 01 “Del laboratorio al ordenador: Fundamentos para el análisis metataxonómico de secuencias para el estudio de comunidades microbianas” Iván Astudillo PhD(c) Instituto de Microbiología Universidad San Francisco de Quito (USFQ) |
| 13:15 – 14:00 | WORKSHOP 02 "Domesticación de cultivos explicado: Implicaciones para el microbioma y sus aplicaciones en la agricultura" Pieter van ’t Hof Ph.D. Colegio de Ciencias Biológicas y Ambientales - COCIBA Universidad San Francisco de Quito - USFQ |
| 14:00 – 16:15 | WORKSHOP 03 “Explorando el Universo de las Micorrizas: Técnicas Avanzadas para el Aislamiento e Identificación de Esporas” Jéssica Duchicela, Ph.D. Departamento de Ciencias de la Vida y de la Agricultura Universidad de las Fuerzas Armadas (ESPE) |
| 16:15 – 17:00 | WORKSHOP 04 “Experiencias & viewing videos de participación de Ecuador en la iniciativa global DARWIN200” [A] PROYECTO @ RAPA NUI: “Rehabilitación comunitaria de suelos y ecosistemas” Samuel Cortese McLean “Rapa Nui enfrenta una grave degradación de los ecosistemas, incluidos problemas de salud del suelo y sostenibilidad agrícola debido a la sobreexplotación de recursos, la deforestación y la erosión del suelo. Se necesitan prácticas urgentes de restauración y sostenibilidad para conservar el medio ambiente, garantizar la sostenibilidad agrícola y desarrollar la resiliencia climática. El líder de Darwin, Samuel Cortese, ha enfrentado el desafío de la rehabilitación de suelos y ecosistemas, haciendo uso de la participación comunitaria, las tradiciones nativas en combinación con tecnologías agrícolas modernas y la biodiversidad de la isla para proporcionar un camino hacia la agricultura sostenible”. [B] PROYECTO @ GALAPAGOS: “Microbioma de tomates de las Galápagos” Iván Astudillo PhD(c) “Sarah Darwin, tataranieta de Charles Darwin, y la Darwin200 líder Hanna Hogenboom participaron en las salidas de campos del proyecto de investigación de Pieter van 't Hof e Iván Astudillo, investigadores de la USFQ/GSC, que busca investigar la diversidad taxonómica y funcional del microbioma de la raíz en poblaciones endémicas de tomate de las Islas Galápagos que sobreviven en condiciones extremas”. |
Programa - Simposio
| Programa (QUITO GMT -5) Viernes 12 de junio de 2026 Modalidad: Híbrido Presencial: Teatro Calderón de la Barca, USFQ Campus Santiago Gangotena - Cumbayá, Quito Virtual: Mediante Zoom |
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|---|---|
| 09:00 – 09:10 | Apertura y Bienvenida Simposio |
| 09:10 – 09:50 | Gabriel Trueba Universidad San Francisco de Quito (Ecuador) "Desafíos de la investigación en microbiomas" |
| 09:50 – 10:30 | Edwin Steven Criollo Arteaga Universidad de las Américas – UDLA & Biosequence (Ecuador) “Microbiota de la piel como herramienta forense en la asociación con objetos personales: un enfoque basado en un pipeline bioinformático de última generación” |
| 10:30 – 10:50 | Shira Landman Tel Aviv University (Israel) "Anthropogenic influence on microbial colonization and degradation of plastics in the Galapagos archipelago" |
| 10:50 – 11:20 | COFFEE BREAK – Teatro Calderón de la Barca |
| 11:20 – 12:00 | Rosa Isabel Soria Tulane University (Estados Unidos) “Soil and endophytic fungal microbiomes as hidden drivers of tropical forest diversity” |
| 12:00 – 12:20 | Nelson Alex Dahua Machoa Explorer SPUN - Society for the Protection of Underground Networks (Global) Pueblo Originario Kichwa de Sarayaku (Ecuador) “Diversidad de hongos micorrízicos en el territorio de Kawsak Sacha” |
| 12:20 – 13:00 | Francisco Javier Flores Flor Universidad de las Fuerzas Armadas (Ecuador) “Análisis Metagenómico Estructural y Funcional de suelos bananeros del Ecuador” |
| 13:00 – 14:30 | ALMUERZO |
| 14:30 – 15:10 | Iván Astudillo Estevez Universidad San Francisco de Quito (Ecuador) “Exploración del microbioma de los tomates endémicos de las Islas Galápagos” |
| 15:10 – 15:50 | Magdalena Díaz Altamirano Universidad Central de Ecuador - UCE (Ecuador) “A continuación” |
| 15:50 – 16:30 | Sara Gabriela Cifuentes Rodríguez Universidad San Francisco de Quito (Ecuador) "Ecosistemas polares bajo presión: impacto humano en la microbiota y el resistoma del agua de mar" |
| 16:30 – 16:45 | Cierre Simposio |
| 16:45 – 18:00 | DRINKS & NETWORKING |
Organizadores
Instituciones invitadas





